PharmacocinétiqueLa , parfois désignée sous le nom de « l'ADME » (voir plus loin) et qui suit la phase biopharmaceutique, a pour but d'étudier le devenir d'une substance active contenue dans un médicament après son administration dans l'organisme. Elle comprend, après la phase biopharmaceutique précédant le premier passage trans-membranaire, quatre grandes étapes : Absorption (A) ; Distribution (D) ; Métabolisme (M) ; Excrétion du principe actif et de ses métabolites (E).
Acétyl-coenzyme AL'acétyl-coenzyme A, usuellement écrite acétyl-CoA, est la forme « activée » de l'acide acétique, c'est-à-dire le thioester que forme ce dernier avec la coenzyme A. C'est une molécule à haut potentiel d'hydrolyse située au carrefour de plusieurs voies métaboliques importantes. L'acétyl-CoA peut ainsi résulter, sous l'action du complexe pyruvate déshydrogénase, de la décarboxylation oxydative du pyruvate, issu par exemple de la glycolyse, ou de la dégradation des acides gras par β-oxydation (hélice de Lynen) dans le cadre de la lipolyse (dégradation des lipides).
HydrolaseLes hydrolases constituent une classe d'enzymes qui catalysent les réactions d'hydrolyse de molécules suivant la réaction générale : On y trouve par exemple les estérases, qui hydrolysent les esters (R-CO-OR'), les peptidases, qui hydrolysent les liaisons peptidiques (AA1-CONH-AA2), les glycosidases, qui hydrolysent les oligo- ou polysaccharides (sucre1-O~sucre2), les phosphatases, qui hydrolysent les produits phosphorés (exemple : ATP + H2O ⇌ ADP + P). Ces enzymes ne nécessitent pas en général de coenzymes.
Phospholipase DLes phospholipases D (PLD) sont des hydrolases associées aux membranes qui catalysent l'hydrolyse des phospholipides, et particulièrement de la phosphatidylcholine, pour générer de la choline et de l'acide phosphatidique. Les mammifères possèdent six isoformes de PLD, notés PLD1 à PLD6. Les PLD1 et PLD2 sont catalytiquement actives, et ce sont les isoformes les mieux décrites à ce jour. Les PLD3, PLD4 et PLD5 ne semblent pas avoir d'activité catalytique et leur fonction est encore discutée.
Rhizosphèrevignette|300px|A=Amibe digérant une bactérie BL= Bactérie à énergie limitée BU= Bactérie à énergie non limitée RC=Racine SR=Poils absorbants racinaires F=Mycélium d'un champignon N=Ver nématode.|alt= La rhizosphère est la région du sol directement formée et influencée par les racines et les micro-organismes associés qui font partie du microbiote des plantes. Cette zone est réduite à une ou deux dizaines de centimètres d'épaisseur sous des pelouses ou des prairies, mais elle est parfois beaucoup plus épaisse dans les forêts des zones tempérées.
