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Adaptation on a genomic scale

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Jacques Fellay, Istvan Bartha
2015
journal articles

Résumé

Sequencing the genome of Candida albicans as it evolves in a patient reveals the genetic changes that allow the yeast to adapt to its environment.

Source officielle

https://infoscience.epfl.ch/entities/publication/22efcb51-92da-405e-9682-d2af46502134

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Proximité ontologique

Génétique: Génomique

Concepts associés (31)

Publications associées (29)

Whole genome sequencing

Whole genome sequencing (WGS), also known as full genome sequencing, complete genome sequencing, or entire genome sequencing, is the process of determining the entirety, or nearly the entirety, of the DNA sequence of an organism's genome at a single time. This entails sequencing all of an organism's chromosomal DNA as well as DNA contained in the mitochondria and, for plants, in the chloroplast. Whole genome sequencing has largely been used as a research tool, but was being introduced to clinics in 2014.

Séquençage de l'ADN

cadre|Résultat du séquençage par la méthode de Sanger. L'ordre de chaque bande indique la position d'un nucléotide A,T,C ou G Le séquençage de l'ADN consiste à déterminer l'ordre d'enchaînement des nucléotides pour un fragment d’ADN donné. La séquence d’ADN contient l’information nécessaire aux êtres vivants pour survivre et se reproduire. Déterminer cette séquence est donc utile aussi bien pour les recherches visant à savoir comment vivent les organismes que pour des sujets appliqués.

En biochimie, le séquençage consiste à déterminer l'ordre linéaire des composants d'une macromolécule (les acides aminés d'une protéine, les nucléotides d'un acide nucléique comme l'ADN, les monosaccharides d'un polysaccharide, etc.). En génétique, le séquençage concerne la détermination de la séquence des gènes voire des chromosomes, voire du génome complet, ce qui techniquement revient à effectuer le séquençage de l'ADN constituant ces gènes ou ces chromosomes.

Comparison of Three Viral Nucleic Acid Preamplification Pipelines for Sewage Viral Metagenomics

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Multi-well plate lid for single-step pooling of 96 samples for high-throughput barcode-based sequencing

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Christina Ernst

How chronic mutational processes and punctuated bursts of DNA damage drive evolution of the cancer genome is poorly understood. Here, we demonstrate a strategy to disentangle and quantify distinct mechanisms underlying genome evolution in single cells, dur ...

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