Whole genome sequencingWhole genome sequencing (WGS), also known as full genome sequencing, complete genome sequencing, or entire genome sequencing, is the process of determining the entirety, or nearly the entirety, of the DNA sequence of an organism's genome at a single time. This entails sequencing all of an organism's chromosomal DNA as well as DNA contained in the mitochondria and, for plants, in the chloroplast. Whole genome sequencing has largely been used as a research tool, but was being introduced to clinics in 2014.
EnterobacterEnterobacter est un genre de bacilles Gram négatifs de la famille des Enterobacteriaceae. Son nom, composé du grec enteron (ἒντερον : intestin) et du néolatin bacter (petit bacille), peut se traduire par « petit bacille intestinal ». L'habitat est l'intestin de l'Homme et des animaux, Enterobacter est aussi trouvé dans les selles, les eaux d'égouts, le sol, les produits laitiers. Certaines souches du genre Enterobacter peuvent être responsables d'infections nosocomiales.
Champignon pathogènevignette|Aspergillose causée par des champignons filamenteux, de type moisissure, du genre Aspergillus (coloration à l'hématoxyline et à l'éosine). vignette|Ulcérations nécrotiques (flèches noires) sur un Gourami nain infecté par des zoospores de l'espèce fongique épizootique . vignette|Fraise atteinte par la pourriture grise (due à un champignon ascomycète, Botrytis cinerea). vignette|Les arbres attaqués par des champignons pathogènes (ici un Sapin géant infecté par une armillaire doivent être abattus et constituent une menace pour l'industrie du bois.
Effluxalt=TolC|vignette|Structure de TolC, protéine de la membrane externe d'Escherichia coli constituant d'une pompe d'efflux tripartite. En biologie, l'efflux est un mécanisme par lequel les cellules rejettent à l'extérieur des composés toxiques : antibiotiques, métaux lourds, drogues... L'efflux est un mécanisme de transport actif, énergie-dépendant, assuré par des protéines transmembranaires appelées pompes d'efflux. On trouve des nombreux systèmes d'efflux chez les bactéries, mais aussi chez les cellules eucaryotes.
Riftia pachyptilaLe ver tubicole géant (Riftia pachyptila) est l'une des espèces extrêmophiles de vers vestimentifères tubicoles vivant dans les grands fonds marins, en colonies pouvant atteindre 100 à 200 individus par m2. C'est une espèce à symbiose obligatoire (avec des bactéries chimioautotrophes). Elle est utilisée comme espèce modèle pour l'étude de ces symbioses, notamment en France à la station de biologie marine de Roscoff. Il s'agit d'un ver souple, de couleur brunâtre, qui peut mesurer jusqu’à 2 mètres de long.
Gangrène gazeuseLa gangrène gazeuse (ou myonécrose clostridienne) est une infection microbienne essentiellement provoquée par une bactérie anaérobie, le Clostridium perfringens. L'infection peut apparaître à la suite de certains types de chirurgie ou de blessures. Cette infection a une diffusion rapide, qui aboutit rapidement à la mort en l’absence de traitement. Des vésicules contenant des bulles de gaz se forment près de la zone infectée et sont accompagnées de fièvre, d’un rythme cardiaque et d’une respiration rapides, et souvent, de douleur au site de l’infection.
LegionellaLes bactéries du genre Legionella, les légionelles, sont des bacilles à Gram négatif généralement présentes dans les milieux humides (eau non salée) et responsables d'une pneumopathie humaine appelée légionellose. L'étymologie du nom de genre Legionella est la suivante : L. fem. n. legio (gen. legionis), une troupe de soldats, légion; L. fem. dim. n. suff. -ella, diminutif pour terminer le mot en signifiant petit; N.L. fem. dim. n. Legionella, une petite troupe, une petite légion.
Selectable markerA selectable marker is a gene introduced into a cell, especially a bacterium or to cells in culture, that confers a trait suitable for artificial selection. They are a type of reporter gene used in laboratory microbiology, molecular biology, and genetic engineering to indicate the success of a transfection or other procedure meant to introduce foreign DNA into a cell. Selectable markers are often antibiotic resistance genes (An antibiotic resistance marker is a gene that produces a protein that provides cells expressing this protein with resistance to an antibiotic.
Marine fungiMarine fungi are species of fungi that live in marine or estuarine environments. They are not a taxonomic group, but share a common habitat. Obligate marine fungi grow exclusively in the marine habitat while wholly or sporadically submerged in sea water. Facultative marine fungi normally occupy terrestrial or freshwater habitats, but are capable of living or even sporulating in a marine habitat. About 444 species of marine fungi have been described, including seven genera and ten species of basidiomycetes, and 177 genera and 360 species of ascomycetes.
Serratia marcescensSerratia marcescens est une espèce de bactérie, de bacille à Gram négatif de la famille des Enterobacteriaceae. Un agent pathogène humain, S. marcescens est impliqué dans des infections nosocomiales, en particulier des bactériémies dans des voies veineuses centrales, des infections urinaires et des infections de plaies. On le trouve couramment dans les voies respiratoires et urinaires d'adultes hospitalisés et dans le système gastro-intestinal des enfants. En raison de sa présence abondante dans l’environnement et de sa préférence pour la vapeur, S.
