Extrémité N-terminaleL'extrémité N-terminale (ou terminaison amine, terminaison aminée, terminaison N ou terminaison NH2) réfère à l’extrémité d'une protéine ou d'un polypeptide se terminant par un acide aminé avec une fonction amine libre (-NH2). La convention d'écriture pour des séquences peptidiques place la terminaison amine à gauche, la séquence étant alors écrite de la terminaison N à la terminaison carboxyle. La traduction de l'ARN messager en protéine s'effectue de la terminaison N à la terminaison C.
Transition de phasevignette|droite|Noms exclusifs des transitions de phase en thermodynamique. En physique, une transition de phase est la transformation physique d'un système d'une phase vers une autre, induite par la variation d'un paramètre de contrôle externe (température, champ magnétique...). Une telle transition se produit lorsque ce paramètre externe atteint une valeur seuil (ou valeur « critique »). La transformation traduit généralement un changement des propriétés de symétrie du système.
Conformation décaléeIn organic chemistry, a staggered conformation is a chemical conformation of an ethane-like moiety abcX–Ydef in which the substituents a, b, and c are at the maximum distance from d, e, and f; this requires the torsion angles to be 60°. It is the opposite of an eclipsed conformation, in which those substituents are as close to each other as possible. Such a conformation exists in any open chain single chemical bond connecting two sp3-hybridised atoms, and is normally a conformational energy minimum.
Lipid polymorphismPolymorphism in biophysics is the ability of lipids to aggregate in a variety of ways, giving rise to structures of different shapes, known as "phases". This can be in the form of spheres of lipid molecules (micelles), pairs of layers that face one another (lamellar phase, observed in biological systems as a lipid bilayer), a tubular arrangement (hexagonal), or various cubic phases (Fdm, Imm, Iam, Pnm, and Pmm being those discovered so far). More complicated aggregations have also been observed, such as rhombohedral, tetragonal and orthorhombic phases.
Lamellar phaseLamellar phase refers generally to packing of polar-headed long chain nonpolar-tail molecules in an environment of bulk polar liquid, as sheets of bilayers separated by bulk liquid. In biophysics, polar lipids (mostly, phospholipids, and rarely, glycolipids) pack as a liquid crystalline bilayer, with hydrophobic fatty acyl long chains directed inwardly and polar headgroups of lipids aligned on the outside in contact with water, as a 2-dimensional flat sheet surface.
Spectroscopie RamanLa spectroscopie Raman (ou spectrométrie Raman) et la microspectroscopie Raman sont des méthodes non destructives d'observation et de caractérisation de la composition moléculaire et de la structure externe d'un matériau, qui exploite le phénomène physique selon lequel un milieu modifie légèrement la fréquence de la lumière y circulant. Ce décalage en fréquence dit l'effet Raman correspond à un échange d'énergie entre le rayon lumineux et le milieu, et donne des informations sur le substrat lui-même.
Modification post-traductionnelleUne modification post-traductionnelle est une modification chimique d'une protéine, réalisée le plus souvent par une enzyme, après sa synthèse ou au cours de sa vie dans la cellule. Généralement cette modification entraîne un changement de la fonction de la protéine considérée, que ce soit au niveau de son action, de sa demi-vie, ou de sa localisation cellulaire.
Projection de Newmanvignette|3 conformères du n-butane (CH3-CH2-CH2-CH3) en vue de Newman : au centre de la figure figurent les deux atomes de carbone du milieu de la chaine, les 3 différentes conformations stables placent relativement les groupements méthyles de chaque extrémité de la chaîne de carbone respectivement à 60° (conformation « gauche»), 180° (conformation « anti », la plus stable) ou 0° (conformation « éclipsée »).
AmphiphileUne espèce chimique (que ce soit une molécule ou un ion) est dite amphilyophile, amphiphile, amphipathique ou bien amphipolaire lorsqu'elle possède à la fois un groupe hydrophile et un groupe hydrophobe. Le groupe hydrophobe est généralement une longue chaîne carbonée de la forme : CH3(CH2)n, avec n compris entre 4 et 16.
Strain (chemistry)In chemistry, a molecule experiences strain when its chemical structure undergoes some stress which raises its internal energy in comparison to a strain-free reference compound. The internal energy of a molecule consists of all the energy stored within it. A strained molecule has an additional amount of internal energy which an unstrained molecule does not. This extra internal energy, or strain energy, can be likened to a compressed spring.
