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Concept
Extrémité N-terminale
Résumé
L'extrémité N-terminale (ou terminaison amine, terminaison aminée, terminaison N ou terminaison NH2) réfère à l’extrémité d'une protéine ou d'un polypeptide se terminant par un acide aminé avec une fonction amine libre (-NH2). La convention d'écriture pour des séquences peptidiques place la terminaison amine à gauche, la séquence étant alors écrite de la terminaison N à la terminaison carboxyle. La traduction de l'ARN messager en protéine s'effectue de la terminaison N à la terminaison C.
Chaque acide aminé possède un groupe carboxyle et un groupe amine, et les acides aminés peuvent se lier à un autre afin de former une chaine au cours d'une réaction de déshydratation par création d'une liaison d'un groupe amine d'un acide aminé au groupe carboxyle du suivant. Les chaines polypeptidiques ont donc une terminaison avec un groupe carboxyle non-lié, la terminaison C, et une terminaison avec un groupe amine, la terminaison N.
Lorsque la protéine est traduite depuis l'ARN messager, elle est créée de la terminaison N à la terminaison C. La terminaison amine d'un acide aminé (sur un ARN de transfert chargé), lors de la phase d'élongation de la traduction, se lie à une terminaison carboxyle de la chaîne naissante ou croissante. Le codon d'initiation du code génétique codant la méthionine, la plupart des séquences protéiques débutent par une méthionine (et plus spécifiquement, la N-formylméthionine (fMet) pour les bactéries). Cependant, certaines protéines sont modifiées dans un processus post-traductionnel, par exemple lors d'une segmentation par un précurseur protéique, et peuvent présenter des acides aminés différents pour leurs terminaisons.
La terminaison N est la première partie de la protéine qui sort du ribosome durant la synthèse protéique. Elle contient parfois des séquences qui agissent comme un signal de ciblage (une sorte de code postal intracellulaire), permettant à la protéine d'atteindre son emplacement prévu dans la cellule. Le signal de ciblage est habituellement supprimé après avoir par une peptidase.
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Proximité ontologique