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Analyzing Semantic Interoperability in Bioinformatic Database Networks

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Graph Chatbot

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Posez n’importe quelle question sur les cours, conférences, exercices, recherches, actualités, etc. de l’EPFL ou essayez les exemples de questions ci-dessous.

AVERTISSEMENT : Le chatbot Graph n'est pas programmé pour fournir des réponses explicites ou catégoriques à vos questions. Il transforme plutôt vos questions en demandes API qui sont distribuées aux différents services informatiques officiellement administrés par l'EPFL. Son but est uniquement de collecter et de recommander des références pertinentes à des contenus que vous pouvez explorer pour vous aider à répondre à vos questions.

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Evaluation

In common usage, evaluation is a systematic determination and assessment of a subject's merit, worth and significance, using criteria governed by a set of standards. It can assist an organization, program, design, project or any other intervention or initiative to assess any aim, realisable concept/proposal, or any alternative, to help in decision-making; or to ascertain the degree of achievement or value in regard to the aim and objectives and results of any such action that has been completed.

Database schema

The database schema is the structure of a database described in a formal language supported typically by a relational database management system (RDBMS). The term "schema" refers to the organization of data as a blueprint of how the database is constructed (divided into database tables in the case of relational databases). The formal definition of a database schema is a set of formulas (sentences) called integrity constraints imposed on a database. These integrity constraints ensure compatibility between parts of the schema.

Department of Defense Architecture Framework

Le Department of Defense Architecture Framework (DoDAF) est un cadre d'architecture destiné au développement d'une architecture de systèmes ou d'une architecture d'entreprise (EA). Tous les achats majeurs d'armes et de systèmes d'information du département de la défense du gouvernement des États-Unis doivent développer une architecture d'entreprise et documenter cette architecture en utilisant l'ensemble de vues prescrites dans DoDAF.

Impact evaluation

Impact evaluation assesses the changes that can be attributed to a particular intervention, such as a project, program or policy, both the intended ones, as well as ideally the unintended ones. In contrast to outcome monitoring, which examines whether targets have been achieved, impact evaluation is structured to answer the question: how would outcomes such as participants' well-being have changed if the intervention had not been undertaken? This involves counterfactual analysis, that is, "a comparison between what actually happened and what would have happened in the absence of the intervention.

Recherche d'information

La recherche d'information (RI) est le domaine qui étudie la manière de retrouver des informations dans un corpus. Celui-ci est composé de documents d'une ou plusieurs bases de données, qui sont décrits par un contenu ou les métadonnées associées. Les bases de données peuvent être relationnelles ou non structurées, telles celles mises en réseau par des liens hypertexte comme dans le World Wide Web, l'internet et les intranets. Le contenu des documents peut être du texte, des sons, des images ou des données.

Metabolic network modelling

Metabolic network modelling, also known as metabolic network reconstruction or metabolic pathway analysis, allows for an in-depth insight into the molecular mechanisms of a particular organism. In particular, these models correlate the genome with molecular physiology. A reconstruction breaks down metabolic pathways (such as glycolysis and the citric acid cycle) into their respective reactions and enzymes, and analyzes them within the perspective of the entire network.

View model

A view model or viewpoints framework in systems engineering, software engineering, and enterprise engineering is a framework which defines a coherent set of views to be used in the construction of a system architecture, software architecture, or enterprise architecture. A view is a representation of the whole system from the perspective of a related set of concerns. Since the early 1990s there have been a number of efforts to prescribe approaches for describing and analyzing system architectures.

Multimedia information retrieval

Multimedia information retrieval (MMIR or MIR) is a research discipline of computer science that aims at extracting semantic information from multimedia data sources. Data sources include directly perceivable media such as audio, and video, indirectly perceivable sources such as text, semantic descriptions, biosignals as well as not perceivable sources such as bioinformation, stock prices, etc. The methodology of MMIR can be organized in three groups: Methods for the summarization of media content (feature extraction).

Web sémantique

vignette|300px|droite|Logo du W3C pour le Web sémantique Le Web sémantique, ou toile sémantique, est une extension du Web standardisée par le World Wide Web Consortium (W3C). Ces standards encouragent l'utilisation de formats de données et de protocoles d'échange normés sur le Web, en s'appuyant sur le modèle Resource Description Framework (RDF). Le Web sémantique est par certains qualifié de Web 3.0. Selon le W3C, . L'expression a été inventée par Tim Berners-Lee (inventeur du Web et directeur du W3C), qui supervise le développement des technologies communes du Web sémantique.

Puce à ADN

thumb|upright=1.2|Principe d'utilisation de la puce à ADN. Une puce à ADN est un ensemble de molécules d'ADN fixées en rangées ordonnées sur une petite surface qui peut être du verre, du silicium ou du plastique. Cette biotechnologie récente permet d'analyser le niveau d'expression des gènes (transcrits) dans une cellule, un tissu, un organe, un organisme ou encore un mélange complexe, à un moment donné et dans un état donné par rapport à un échantillon de référence.