DNA demethylationFor molecular biology in mammals, DNA demethylation causes replacement of 5-methylcytosine (5mC) in a DNA sequence by cytosine (C) (see figure of 5mC and C). DNA demethylation can occur by an active process at the site of a 5mC in a DNA sequence or, in replicating cells, by preventing addition of methyl groups to DNA so that the replicated DNA will largely have cytosine in the DNA sequence (5mC will be diluted out). Methylated cytosine is frequently present in the linear DNA sequence where a cytosine is followed by a guanine in a 5' → 3' direction (a CpG site).
Circular chromosomeA circular chromosome is a chromosome in bacteria, archaea, mitochondria, and chloroplasts, in the form of a molecule of circular DNA, unlike the linear chromosome of most eukaryotes. Most prokaryote chromosomes contain a circular DNA molecule – there are no free ends to the DNA. Free ends would otherwise create significant challenges to cells with respect to DNA replication and stability. Cells that do contain chromosomes with DNA ends, or telomeres (most eukaryotes), have acquired elaborate mechanisms to overcome these challenges.
PlastomeL'ADN chloroplastique (ADNcp) ou plastome est le matériel génétique situé dans les plaste, qui sont des organites photosynthétiques situés dans les cellules de certains organismes eucaryotes tels que les chloroplastes des cellules végétales. Les chloroplastes, comme les autres types de plastides, contiennent un génome distinct de celui du noyau cellulaire. L'existence de l'ADN chloroplastique est identifiée biochimiquement en 1959, et confirmée par microscopie électronique en 1962.
RépliconUn réplicon est une molécule d'ADN ou d'ARN, ou une région d'ADN ou d'ARN pouvant se répliquer à partir d'une seule origine de réplication (ori). Le réplicon est l'unité de réplication de l'ADN bicaténaire. Chez la plupart des procaryotes, le réplicon représente l'ensemble du chromosome. On trouve cependant des exceptions, chez les archées où deux espèces de Sulfolobus contiennent trois réplicons, ou chez les bactéries où certaines espèces présentant plusieurs réplicons ; c'est le cas par exemple de : Rhodobacter sphaeroides, Vibrio cholerae, ou encore Burkholderia multivorans.
Nuclear geneA nuclear gene is a gene whose physical DNA nucleotide sequence is located in the cell nucleus of a eukaryote. The term is used to distinguish nuclear genes from genes found in mitochondria or chloroplasts. The vast majority of genes in eukaryotes are nuclear. Mitochondria and plastids evolved from free-living prokaryotes into current cytoplasmic organelles through endosymbiotic evolution. Mitochondria are thought to be necessary for eukaryotic life to exist.
DNA synthesisDNA synthesis is the natural or artificial creation of deoxyribonucleic acid (DNA) molecules. DNA is a macromolecule made up of nucleotide units, which are linked by covalent bonds and hydrogen bonds, in a repeating structure. DNA synthesis occurs when these nucleotide units are joined to form DNA; this can occur artificially (in vitro) or naturally (in vivo). Nucleotide units are made up of a nitrogenous base (cytosine, guanine, adenine or thymine), pentose sugar (deoxyribose) and phosphate group.
Banque génomiqueUne banque génomique est une collection de l'ADN génomique total d'un seul organisme. L'ADN est stocké dans une population de vecteurs identiques, chacun contenant un insert d'ADN différent. Afin de construire une banque génomique, l'ADN de l'organisme est extrait des cellules puis digéré par une enzyme de restriction pour couper l'ADN en fragments d'une taille spécifique. Les fragments sont ensuite insérés dans le vecteur à l'aide de la ligase.
DNA transposonDNA transposons are DNA sequences, sometimes referred to "jumping genes", that can move and integrate to different locations within the genome. They are class II transposable elements (TEs) that move through a DNA intermediate, as opposed to class I TEs, retrotransposons, that move through an RNA intermediate. DNA transposons can move in the DNA of an organism via a single-or double-stranded DNA intermediate. DNA transposons have been found in both prokaryotic and eukaryotic organisms.
Autophagievignette|droite|upright=1.0|Mécanisme de l'autophagie. L’autophagie (du grec : , et ), autolyse ou autophagocytose, est un mécanisme physiologique, intracellulaire, de protection et de recyclage d'éléments cellulaires : les organites indésirables ou endommagés, un pathogène introduit dans la cellule, des protéines mal repliées... sont ainsi collectés et transportés vers les lysosomes pour être dégradés. Une partie du cytoplasme est ainsi recyclé par ses propres lysosomes.
TetrahymenaTetrahymena est un genre de ciliés pouvant être commensaux ou pathogènes. Les espèces sont très communes dans l'eau douce. Ses dimensions normales sont de de longueur et de de largeur. Les chercheurs en biochimie utilisent les espèces Tetrahymena thermophila et Tetrahymena pyriformis comme organisme modèle. On a par exemple montré que cette espèce dispose de récepteurs hormonaux, dont l'un induit la production de mélatonine par le protozoaire, quand il est exposé à de faibles dose de cette hormone, notamment impliqué dans la photoadaptation avec des effets d'attractivité vers la lumière le jour, de chemotactisme la nuit et autres.
