Le , anciennement appelé Onjō-ji (園城寺), est un temple bouddhiste situé au pied du mont Hiei, à Ōtsu, dans la préfecture de Shiga. Il n'est qu'à une faible distance de Kyoto et du lac Biwa, le plus grand lac du Japon. Temple principal de la secte Tendai Jimon, et en quelque sorte un temple-sœur de l'Enryaku-ji, au sommet de la montagne. C'est l'un des quatre plus grands temples du Japon. En tout s'y trouvent quarante bâtiments.
En 672, l'Onjō-ji est fondé, à la suite d'une dispute au sujet de la succession sur le trône du chrysanthème. L'empereur Tenji était mort, et son fils avait été tué par le frère de Tenji, qui avait accédé au trône sous le nom d'« empereur Tenmu ». Temmu fonda l'Onjō-ji pour honorer la mémoire de son frère.
Environ deux siècles après, le temple est renommé Mii-dera, (littéralement : « temple des trois puits »), par Enchin, l'un des premiers abbés de la secte Tendai. Le nom vient des sources du temple qui étaient utilisées pour le bain rituel des nouveau-nés, et en l'honneur des empereurs Tenji et Tenmu et de l'impératrice Jitō, qui contribua à la fondation du temple. Aujourd'hui, le kondō, ou hall principal, héberge une source d'eau sacrée. Sous la houlette d'Enchin, de 859 à sa mort en 891, le Mii-dera gagna de la puissance et de l'importance, devenant finalement, aux côtés du Tōdai-ji, du Kōfuku-ji et de l'Enryaku-ji, l'un des quatre temples chargés de la direction spirituelle et de la protection de la capitale.
C'est également à cette époque que se fait la séparation entre l'Enryaku-ji et le Mii-dera, se développant en deux branches de la secte Tendai, appelées Jimon et Sanmon. Il s'agissait en fait plus d'une rivalité géographique que d'un schisme idéologique, mais c'était néanmoins une séparation importante, et elle ne devint que plus sévère après la mort d'Enchin. La rivalité devint violente dans la seconde moitié du , au sujet d'une série de nominations officielles d'autres temples, et de litiges similaires. Les abbés (zazu) de l'Enryaku-ji de 970 forment la première armée régulière à être recrutée par un corps religieux.