Microbiote de l'organisme humain
Le microbiote de l'organisme humain, anciennement dénommé flore microbienne de l'organisme humain, est l'ensemble des bactéries, microchampignons et autres micro-organismes que le corps humain contient en grand nombre. Le plus étudié des microbiotes humains est le microbiote intestinal. Le microbiote intestinal est extrêmement divers (biodiversité taxonomique, génétique et fonctionnelle). Il varie selon les individus et fluctue dans le temps, surtout dans les mois qui suivent la naissance et en période de maladie. La plupart des organismes du microbiote sont naturellement présents sur la peau ou dans le tube digestif où ils effectuent des tâches utiles, voire essentielles à la survie de l'individu hôte. Dans des circonstances normales, ils ne provoquent pas de maladies (ils sont également désignées sous le nom de « flore normale »). Ils forment une qui . Cette communauté est parfois considérée comme une communauté symbiote. Le plus connu des organismes du microbiote est la bactérie Escherichia coli, qui vit dans le côlon. Si le système immunitaire est affaibli, la plupart de ces bactéries de la flore normale agissent en tant que pathogènes opportunistes. microbiote intestinal humain Le microbiote humain est très varié. Au sein d'une même population, chaque individu porte un microbiote différent (composition différente et proportion différente par exemple de Bacteroidetes, Fusobacteria ou Firmicutes et certaines familles, notamment de Ruminococcaceae et Lachnospiraceae sont particulièrement riches en phylotypes). Enfin, pour chaque grande région du monde, les micro-organismes diffèrent aussi. Le microbiote de chacun évolue beaucoup entre la naissance (microbiote placentaire) et la fin de l'adolescence pour se stabiliser à l'âge adulte. On estime qu'il y a entre 15 et espèces de bactéries différentes vivant dans le corps humain, ce nombre augmentant régulièrement avec le progrès des recherches et restant encore débattu. Il contient aussi en moindre quantité des archées, qui auraient en particulier un rôle important dans le développement de l'athérosclérose, par la régulation de l'oxyde de triméthylamine.
