Concept
thumb|upright=1.2|L'inhibiteur de la ribonucléase en forme de fer à cheval (en représentation « fil de fer ») forme une interaction protéine–protéine avec la protéine de la ribonucléase. Les contacts entre les deux protéines sont représentés sous forme de taches colorées. Une Interaction protéine–protéine apparait lorsque deux ou plusieurs protéines se lient entre elles, le plus souvent pour mener à bien leur fonction biologique. Beaucoup des molécules les plus importantes qui agissent dans la cellule, comme le réplication de l'ADN, sont mises en œuvre par de grosses machines moléculaires qui sont constituées d'un grand nombre de protéines organisées grâce aux interactions protéine-protéine. Les interactions entre protéines ont été étudiées du point de vue de la biochimie, de la chimie quantique, de la dynamique moléculaire, de la chimie biologique, de la transduction de signal et autres théorie des graphes métabolique et génétique/épigénétique. Les interactions protéine-protéines sont au cœur de tout le système interactomique de la cellule vivante. Les interactions entre protéines sont importantes pour la plupart des fonctions génétiques. Par exemple, un signal provenant de l'extérieur de la cellule est transmis à l'intérieur par des interactions protéine-protéine des molécules constituant le signal. Ce mode opératoire, appelé « transduction de signal », joue un rôle fondamental dans la plupart des processus biologiques et dans de nombreuses maladies comme les cancers, par exemple. Les protéines peuvent interagir pendant de longues périodes pour former un morceau de complexe protéinique, une protéine peut transporter une autre protéine (par exemple du cytoplasme au noyau ou vice versa dans le cas d'importines de pores nucléaires), ou encore une protéine peut interagir brièvement avec une autre protéine, uniquement pour la modifier (par exemple, une protéine kinase va ajouter un radical phosphate à une protéine cible). Cette modification de protéine peut elle-même, à son tour, changer les interactions protéine-protéine.
