Concept
Protein function prediction
Personnes associées (38)
John Richard Thome
John R. Thome is Professor of Heat and Mass Transfer at the Swiss Federal Institute of Technology in Lausanne (EPFL), Switzerland since 1998, where his primary interests of research are two-phase flow and heat transfer, covering both macro-scale and micro-scale heat transfer and enhanced heat transfer. He directs the Laboratory of Heat and Mass Transfer (LTCM) at the EPFL with a research staff of about 18-20 and is also Director of the Doctoral School in Energy. He received his Ph.D. at Oxford University, England in 1978. He is the author of four books: Enhanced Boiling Heat Transfer (1990), Convective Boiling and Condensation, 3rd Edition (1994), Wolverine Engineering Databook III (2004) and Nucleate Boiling on Micro-Structured Surfaces (2008). He received the ASME Heat Transfer Division's Best Paper Award in 1998 for a 3-part paper on two-phase flow and flow boiling heat transfer published in the Journal of Heat Transfer. He has received the J&E Hall Gold Medal from the U.K. Institute of Refrigeration in February, 2008 for his extensive research contributions on refrigeration heat transfer and more recently the 2010 ASME Heat Transfer Memorial Award. He has published widely on the fundamental aspects of microscale and macroscale two-phase flow and heat transfer and on enhanced boiling and condensation heat transfer.
Bruno Emanuel Ferreira De Sousa Correia
Throughout my PhD and postdoctoral studies I was trained in world-renowned laboratories and institutions in the United States of America (University of Washington and The Scripps Research Institute). Very early in my scientific career I found out my fascination about protein structure and function. My PhD studies evolved in the direction of immunogen design and vaccine engineering which sparked my interest in the many needs and opportunities in vaccinology and translational research. My efforts resulted in an enlightening piece of work where for the first time, computationally designed immunogens elicited potent neutralizing antibodies. During my postdoctoral studies I joined a chemical biology laboratory at the Scripps Research Institute. In this stage I developed novel chemoproteomics methods for the identification of protein-small molecule interaction sites in complex proteomes. In March 2015, I joined the École Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL) – Switzerland as a tenure track assistant professor. The focus of my research group is to develop computational tools for protein design with particular emphasis in applying these strategies to immunoengineering (e.g. vaccine and cancer immunotherapy). The activities in my laboratory focus on computational design methods development and experimental characterization of the designed proteins. Our laboratory has been awarded with 2 prestigious research grants from the European Research Council. Lastly, I have been awarded the prize for best teacher of Life sciences in 2019.
Vassily Hatzimanikatis
Dr. Vassily Hatzimanikatis is currently Associate Professor of Chemical Engineering and Bioengineering at Ecole Polytechnique Federale de Lausanne (EPFL), in Lausanne, Switzerland. Vassily received a PhD and an MS in Chemical Engineering from the California Institute of Technology, and his Diploma in Chemical Engineering from the University of Patras, in Greece. After the completion of his doctoral studies, he held a research group leader position at the Swiss Federal Institute of Technology in Zurich (ETHZ), Switzerland. Prior to joining EPFL, Vassily worked for three years in DuPont, Cargill, and Cargill Dow, and he has been assistant professor at Northwestern University, at Illinois, USA.
Vassilys research interests are in the areas of computational systems biology, biotechnology, and complexity. He is associate editor of the journals Biotechnology & Bioengineering, Metabolic Engineering and Integrative Biology, and he serves on the editorial advisory board of the journals Bioprocess and Biosystems Engineering, Journal of Chemical Technology and Biotechnology, and Industrial Biotechnology. He has written over 70 technical publications and he is co-inventor in three patents and patent applications.
Vassily is a fellow of the American Institute for Medical and Biological Engineering (2010), he was a DuPont Young Professor (2001-2004), and he has also received the Jay Bailey Young Investigator Award in Metabolic Engineering (2000), and the ACS Elmar Gaden Award (2011).
Horst Vogel
Horst Vogel est né en 1948 à Würzburg, Allemagne. Après ses études en chimie, il obtient le diplôme de chimie en 1974 de l'Université de Würzburg.Il entreprend ensuite un travail de doctorat au Max-Planck Institut für Biophysikalische Chemie de Göttingen, et obtient en 1978 le grade de docteur ès sciences de l'Université de Göttingen. De 1978 à 1983 il effectue des recherches au Max-Planck Institut für Biologie à Tübingen et en 1984, il rejoint le Biocentre à Bâle où il travaille jusqu'en 1989, effectuant une année au Karolinska Institute à Stockholm. En 1989, Horst Vogel rejoint l'institut de chimie physique de l'EPFL où il dirige un groupe travaillant dans les domaines de la biophysique et de la bioélectronique.
Depuis le 1er octobre 1994 il est profeseur en chimie physique des polymères et membranes au Département de chimie de EPFL. Ses intérêts de recherche sont l'étude de la structure et de la dynamique de récepteurs membranaires et l'auto-assemblage des biomolécules aux interfaces pour développer de nouveaux biocapteurs dans le domaine de micro- et nanotechnologie. Il enseigne les sciences du vivant, la biophysique et biochimie, et des chapitres concernant la biotechnologie.
Dipl. in Chemistry1974-Univ. Würzburg, DE
Ph.D.-1978-MPI für Biophys. Chemie, Göttingen, DE
François Avellan
Le professeur François Avellan, directeur du Laboratoire de machines hydrauliques de l'EPFL, est Ingénieur hydraulicien diplômé en 1977 de l'Ecole nationale supérieure d'hydraulique, Institut national polytechnique de Grenoble, France. En 1980, il obtient, son titre de docteur ingénieur de l'Université d'Aix-Marseille II, France. Engagé à l'EPFL en 1980 en tant qu'adjoint scientifique, il est depuis 1994 directeur du Laboratoire de machines hydrauliques de l'EPFL et il a été nommé en 2003 professeur ordinaire en machines hydrauliques.
Directeur de 37 thèses de doctorat de l'EPFL, il a été distingué par la Société hydrotechnique de France qui lui a décerné son "Grand Prix 2010 de l'hydrotechnique". Son activité de recherche est centrée sur l'hydrodynamique des turbomachines, pompes et pompes-turbines incluant en particulier les domaines de la cavitation, l'hydroacoustique, les interactions fluide-structure, la conception et l'évaluation des performances des machines hydrauliques et systèmes associés.
De 2002 à 2012, le Professeur Avellan a présidé la section machines hydrauliques et systèmes de l'Association internationale de recherche hydraulique, AIRH. Le Professeur François Avellan a dirigé avec succès plusieurs projets de recherche aussi bien suisses qu'internationaux en partenariat avec les principaux acteurs industriels et exploitants du secteur hydro-électrique, parmi ces projet-on peut citer notamment:
- Coordination du projet de recherche FP7 n° 608532 "HYPERBOLE: HYdropower plants PERformance and flexiBle Operation towards Lean integration of new renewable Energies" (2013-2017);
- Directeur adjoint du pole Suisse de compétence en recherche énergétique – approvisionnement électrique (SCCER-SoE) pour développer une recherche innovante et pérenne dans le domaine des géo-énergies et de l'hydro-électricité pour la phase I (2013-2016) et la Phase II (2017, 2010).
- Projets de recherche EUREKA: N° 4150 et N° 3246, "HYDRODYNA, Harnessing the dynamic behavior of pump-turbines", (2003-2011), N° 1605, "FLINDT, Flow Investigation in Draft Tubes", (1997-2002). N° 2418, "SCAPIN, Stability of Operation of Francis turbines, prediction and modeling";
- Projets de recherche de la Commission pour la technologie et l'innovation, CTI, avec GE Renewable Energy (anc. ALSTOM Hydro), Birr, ANDRITZ Hydro, Kriens, FMV, Sion, Groupe E, Granges-Paccot, Power Vision engineering, Ecublens et SULZER Pompes, Winterthur.
- Domaine des EPF, Projet HYDRONET du Centre de Compétence énergie et mobilité, PSI Villingen.
Michele Ceriotti
Michele Ceriotti received his Ph.D. in Physics from ETH Zürich in 2010. He spent three years in Oxford as a Junior Research Fellow at Merton College. Since 2013 he leads the laboratory for Computational Science and Modeling in the Institute of Materials at EPFL. His research revolves around the atomic-scale modelling of materials, based on the sampling of quantum and thermal fluctuations and on the use of machine learning to predict and rationalize structure-property relations. He has been awarded the IBM Research Forschungspreis in 2010, the Volker Heine Young Investigator Award in 2013, an ERC Starting Grant in 2016, and the IUPAP C10 Young Scientist Prize in 2018.
Dario Floreano
Prof. Dario Floreano is director of the Laboratory of Intelligent Systems at the Swiss Federal Institute of Technology Lausanne (EPFL). Since 2010, he is the founding director of the Swiss National Center of Competence in Robotics, a research program that brings together more than 20 labs across Switzerland. Prof. Floreano holds an M.A. in Vision, an M.S. in Neural Computation, and a PhD in Robotics. He has held research positions at Sony Computer Science Laboratory, at Caltech/JPL, and at Harvard University. His main research interests are Robotics and A.I. at the convergence of biology and engineering. Prof. Floreano made pioneering contributions to the fields of evolutionary robotics, aerial robotics, and soft robotics. He served in numerous advisory boards and committees, including the Future and Emerging Technologies division of the European Commission, the World Economic Forum Agenda Council, the International Society of Artificial Life, the International Neural Network Society, and in the editorial committee of several scientific journals. In addition, he helped spinning off two drone companies (senseFly.com and Flyability.com) and a non-for-profit portal on robotics and A.I. (RoboHub.org). Books
Manuale sulle Reti Neurali, il Mulino (in Italian), 1996 (first edition), 2006 (second edition)Evolutionary Robotics, MIT Press, 2000
Bio-Inspired Artificial Intelligence, MIT Press, 2008
Flying Insects and Robots, Springer Verlag, 2010
Christof Holliger
Originaire d'Adliswil, Christof Holliger est né en 1959. Diplômé de l'ETHZ en biologie en 1984, il mène des travaux de recherche dans le domaine de la microbiologie environnementale à l'Université d'Agriculture de Wageningen (Pays-Bas) où il obtient son doctorat en Science de l'environnement en 1992. En 1992, il retourne en Suisse engagé comme collaborateur scientifique et chef de groupe à l'Institut Fédéral pour l'Aménagement, l'Epuration et la Protection des Eaux (EAWAG) à Kastanienbaum. Il y continue ses recherches sur la déchloruration réductrice, commencées aux Pays-Bas, et dirige des travaux sur la réduction des composés nitroaromatiques, la réduction du fer et la méthanogenèse psychrophile dans les sédiments des lacs. En octobre 1998, il est nommé professeur assistant en biotechnologie environnementale au Département de génie rural de l'EPFL. Ses recherches visent l'application des micro-organismes anaérobies pour le traitement des eaux résiduaires. En novembre 2004, il est nommé professeur associé et devient responsable du laboratoire de biotechnologie environnementale à la Faculté de l'Environnement naturel, architectural et construit. L'utilisation des techniques de la biologie moléculaire pour la caractérisation des communautés microbiennes impliquées dans le biotraitement de l'air, des eaux et des sols pollués est un outil clé dans les différents projets de recherche visants le développement des nouveaux procédés de traitement.