Glycane

Résumé

Un glycane est un polymère composé de monosaccharides reliés entre eux par une liaison glycosidique. Chez les bactéries et toutes les espèces vivantes, sous forme d'oligo ou de polysaccharides attachés à des glycolipides et glycoprotéines, ils jouent un rôle fondamental dans les membranes cellulaires et la communication intercellulaire. Ils sont une partie importante du glycome. Ils jouent un rôle important dans la cellule pour le bon repliement des protéines dans le réticulum endoplasmique, via les protéines chaperons. Chez l'animal, ils jouent un rôle majeur tant au niveau cellulaire, qu'au niveau de l'organisme, comme pour la chitine des crustacés par exemple. On les trouve souvent sous forme de chaine d'oligosaccharides liés aux protéines (glycoprotéines), de peptido-glycanes et de protéoglycanes. Les végétaux produisent des glycanes complexes et particulièrement résistants, dont la cellulose. Glycanes et protéines La composition des glycanes d'une protéin

Source officielle

https://fr.wikipedia.org/wiki/Glycane

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SWISS CHEMICAL SOC2022

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Identification of Mobility-Resolved N-Glycan Isomers

Priyanka Bansal, Ahmed Ben Faleh, Robert Paul Pellegrinelli, Thomas Rizzo, Stephan Warnke

ABSTRACT: Glycan analysis has evolved considerably during the last decade. The advent of high-resolution ion-mobility spectrometry has enabled the separation of isomers with only the slightest of structural differences. However, the ability to separate such species raises the problem of identifying all the mobility-resolved peaks that are observed, especially when analytical standards are not available. In this work, we report an approach based on the combination of IMSn with cryogenic vibrational spectroscopy to identify N-glycan reducing-end anomers. By identifying the reducing-end alpha and beta anomers of diacetyl-chitobiose, which is a disaccharide that forms part of the common core of all N-glycans, we are able to assign mobility peaks to reducing anomers of a selection of N-glycans of different sizes, starting from trisaccharides such as Man-1 up to glycans containing nine monosaccharide units, such as G2. By building an infrared fingerprint database of the identified N-glycans, our approach allows unambiguous identification of mobility peaks corresponding to reducing-end anomers and distinguishes them from positional isomers that might be present in a complex mixture.

AMER CHEMICAL SOC2022

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A New Strategy Coupling Ion-Mobility-Selective CID and Cryogenic IR Spectroscopy to Identify Glycan Anomers

Priyanka Bansal, Ahmed Ben Faleh, Eduardo Carrascosa Casado, Robert Paul Pellegrinelli, Thomas Rizzo, Stephan Warnke, Lei Yue

Determining the primary structure of glycans remains challenging due to their isomeric complexity. While high-resolution ion mobility spectrometry (IMS) has recently allowed distinguishing between many glycan isomers, the arrival-time distributions (ATDs) frequently exhibit multiple peaks, which can arise from positional isomers, reducing-end anomers, or different conformations. Here, we present the combination of ultrahigh-resolution ion mobility, collision-induced dissociation (CID), and cryogenic infrared (IR) spectroscopy as a systematic method to identify reducing-end anomers of glycans. Previous studies have suggested that high-resolution ion mobility of sodiated glycans is able to separate the two reducing-end anomers. In this case, Y-fragments generated from mobility-separated precursor species should also contain a single anomer at their reducing end. We confirm that this is the case by comparing the IR spectra of selected Y-fragments to those of anomerically pure mono- and disaccharides, allowing the assignment of the mobility-separated precursor and its IR spectrum to a single reducing-end anomer. The anomerically pure precursor glycans can henceforth be rapidly identified on the basis of their IR spectrum alone, allowing them to be distinguished from other isomeric forms.

2022

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