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Concept
Glycome
Résumé
Le glycome désigne en biologie l'effectif total de sucres (ou glucides) d'une cellule (bactérie par exemple) ou d'un organisme, que ces sucres soient libres ou présents de manière polymérisée (amidon par exemple) dans des molécules complexes.
Le glycome, omniprésent dans le vivant, est aux échelles nanométriques et microscopiques l'une des entités les plus complexes du monde nature, plus complexe et varié encore que le monde des protéines.
On parle parfois de glycomique (glycomics pour les anglophones), par analogue à génomique et à la protéomique pour désigner l'étude systématique de tous les glycanes des structures d'un type cellulaire donné ou d'un organisme. C'est un sous-ensemble de la glycobiologie.
Glucide, glycane, saccharide, ose et sucre sont des termes génériques utilisés de manière interchangeable dans ce contexte. Ils comprennent les monosaccharides, oligosaccharides, polysaccharides, et divers dérivés de ces composés.
Les glucides sont parfois à tort appelés hydrates de carbone. En effet bien que certains sucres comme le glucose (partageant la formule brute C6H12O6 avec des isomères comme le fructose, le galactose...) répondent à la formulation (C-H2O)n, suggérant que les sucres sont des hydrates de carbone, elle est trompeuse car d'une part certains sucres présenteront des fonctions amines (osamines) ou seront des esters phosphoriques (ex: glucose 6 phosphate) ou sulfuriques (ex: dans le chondroitine sulfate que l'on retrouve dans les articulations des vertébrés, certains résidus osidiques présentent des résidus sulfates). Enfin certains composés vérifiant la formulation d'hydrates de carbone ne sont pas des sucres (ex: acide acétique). Les monosaccharides sont des sucres qui ne peuvent être hydrolysés en un simple autre monosaccharide et sont les éléments constitutifs des oligosaccharides et des polysaccharides.
Les oligosaccharides sont des chaînes linéaires ou ramifiées de monosaccharides attachés les uns aux autres par des liaisons glucosidiques. Le nombre d'unités monosaccharide peut varier.
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