La vaginose bactérienne est causée par un déséquilibre du microbiote bactérien naturellement présent dans le vagin. Les espèces de lactobacilles normalement prédominantes sont nettement réduites. Voici la liste des organismes présents dans le vagin lors d'une vaginose bactérienne, une maladie infectieuse du vagin causée par une croissance excessive de bactéries spécifiques. La nature des microorganismes présents et leurs relations sont modifiées lors d'une vaginose bactérienne, ce qui conduit à un milieu bactérien complexe. Certaines espèces n'ont été identifiées que récemment. Le fait d'être infectée par les agents pathogènes énumérés augmente le risque de contracter d'autres infections sexuellement transmissibles, notamment le sida. Bacterial vaginosis: a review on clinial trials with probiotics (2013) A Metagenomic Approach to Characterization of the Vaginal Microbiome Signature in Pregnancy. Kjersti Aagaard, Kevin Riehle, Jun Ma, Nicola Segata, Toni-Ann Mistretta, Cristian Coarfa, Sabeen Raza, Sean Rosenbaum, Ignatia Van den Veyver, Aleksandar Milosavljevic, Dirk Gevers, Curtis Huttenhower, Joseph Petrosino, James Versalovic. PLoS ONE volume 7, issue 6.