Concept
Cofacteur (biochimie)
Concepts associés (60)
Complexe pyruvate déshydrogénase
Le complexe pyruvate déshydrogénase (PDC) est l'association de trois enzymes intervenant séquentiellement pour catalyser la décarboxylation oxydative du pyruvate en acétyl-CoA. Le pyruvate est notamment issu de la glycolyse, tandis que l'acétyl-CoA est, par exemple, le point d'entrée du cycle de Krebs, qui fonctionne dans la foulée de la chaîne respiratoire pour parachever l'oxydation du groupement acétyle de l'acétyl-CoA.
Cyanocobalamine
La cyanocobalamine est la forme commercialement la plus courante de la , car la plus stable à l'air libre et la plus facile à cristalliser, et donc à purifier une fois produite par fermentation bactérienne ou par synthèse in vitro. Il s'agit d'une forme synthétique de provitamine , qu'on ne trouve pas dans le milieu naturel. Les bactéries produisent en effet de l'hydroxocobalamine, convertie en cyanocobalamine en passant dans du charbon actif, lequel contient naturellement des ions cyanure CN− ; l'hydroxocobalamine ayant une forte affinité pour les ions cyanure, ceux-ci déplacent l'ion hydroxyde OH− et se fixent sur la cobalamine.
Phosphate de pyridoxal
Le phosphate de pyridoxal (PLP) est une coenzyme dérivée d'une vitamine, la pyridoxine (vitamine ). C'est un groupement prosthétique. Il intervient dans le métabolisme en permettant entre autres la transamination ou la décarboxylation des acides aminés. Son site actif est la fonction aldéhyde sur l'atome de carbone 4. C'est une coenzyme des aminotransférases et des décarboxylases. La réaction de l'ALAT (alanine aminotransférase ou Glutamate pyruvate transaminase) est la suivante, montrant le rôle du coenzyme.
Azotobacter
Azotobacter est un genre de bactéries appartenant à la classe des Gammaproteobacteria. Les cellules sont ovoïdes et relativement larges (2 à , jusqu'à ). Ces bactéries sont des aérobies strictes, hétérotrophes et présentent la capacité de fixer l'azote atmosphérique. En l’absence de nourriture, la cellule peut s’entourer d’une enveloppe épaisse résistant à la sécheresse : cyste ou kyste. Ceux-ci sont remplis de poly-β-hydroxybutyrates (PHB) qui sont utilisés par les bactéries en cas de stress environnementaux comme source de stockage d’énergie.
Cétoacide
Les cétoacides sont des acides organiques portant une fonction acide carboxylique et une fonction cétone. On divise cette famille en sous-familles, en classant les composés par rapport aux positions respectives des deux fonctions. On compte parmi ces sous-familles: les alpha-cétoacides, ou 2-oxoacides, qui comme l'acide pyruvique ou le 2-oxoglutarate ou le 2-oxoisovalérate, ont leur fonction cétone adjacente à leur groupe carboxyle (sur le carbone α).
Flavine mononucléotide
La flavine mononucléotide (FMN), ou riboflavine-5′-phosphate, est une biomolécule produite à partir de la riboflavine (vitamine B2) par l'enzyme riboflavine kinase et agit comme groupement prosthétique de diverses oxydo-réductases, comme la NADH déshydrogénase, mais aussi comme cofacteur avec les bio-photorécepteurs de lumière bleue. Durant le cycle catalytique, il se produit une interconversion réversible entre les formes oxydée (FMN), semiquinone (FMNH•) et réduites (FMNH2).
Auxotrophie
L'auxotrophie est l'incapacité d'un organisme vivant de synthétiser un composé organique nécessaire à son développement. Un auxotrophe est un organisme qui est caractérisé par ce défaut. Pour l'inverse, on parle de prototrophie. En génétique, une souche est dite auxotrophe lorsqu'elle présente une mutation qui rend impossible la synthèse d'un métabolite essentiel. Par exemple une levure mutante, portant une mutation bloquant la synthèse d'uracile est auxotrophe à l'uracile.
Isocitrate déshydrogénase
L ́isocitrate déshydrogénase (IDH) est une oxydoréductase qui catalyse la réaction : isocitrate + NADP+ / NAD+ α-cétoglutarate + + NADPH / NADH + H+. Cette réaction globale se déroule en deux étapes : isocitrate + NADP+ / NAD+ oxalosuccinate + NADPH / NADH + H+ ; oxalosuccinate α-cétoglutarate + . Chez l'homme, cette enzyme existe en trois isoformes appelées IDH1, IDH2 et IDH3.
Sérine hydroxyméthyltransférase
La sérine hydroxyméthyltransférase (SHMT) est une transférase qui catalyse la réaction : 5,10-méthylènetétrahydrofolate + glycine + tétrahydrofolate + L-sérine. Cette enzyme joue un rôle important dans les voies métaboliques des composés à un seul atome de carbone en catalysant la conversion simultanée et réversible de la en glycine et du tétrahydrofolate en . Cette réaction fournit la plus grande partie des unités monocarbonées pour les biosynthèses de la cellule.
Réductase
Une réductase est une enzyme qui diminue l'énergie d'activation d'une réaction d'oxydo-réduction. 5-alpha réductase, enzyme du métabolisme de la testostérone, cytochrome b5 réductase Folate et Dihydrofolate réductase HMG-CoA réductase (ou 3-hydroxy-3-méthyl-glutaryl-CoA réductase ou HMGR) est la première en enzyme (EC 1.1.1.88) du chemin métabolique de la HMG-CoA réductase, qui produit le cholestérol et d'autres biomolécules. Glutathion réductase Méthémoglobine réductase Ribonucléotide réductase oxydase Cat