vignette|Organisation d'une muqueuse (épithélium, membrane basale et chorion). En rouge, un vaisseau qui va nourrir l'épithélium grâce au chorion. Une muqueuse (du latin mucus) est une mince couche de tissu constituée d'un épithélium, et de tissu conjonctif sous-jacent qui se nomme chorion. Les muqueuses tapissent les cavités du corps qui sont en continuité avec la peau. Épithélium et chorion sont séparés par une lame basale. L'infection d'une muqueuse est appelée « mucite ». Les muqueuses sont présentes au niveau des parois : du tube digestif (de la bouche à l'anus), faisant partie de l'appareil digestif humain ; de l'appareil respiratoire ; de l'appareil uro-génital (utérus, vagin, urètre, vessie, uretères, gland du pénis et du clitoris, face interne du prépuce). La spécificité des muqueuses est d'être en permanence humide ou humidifiée, comme les muqueuses urinaires avec l'urine. Elles sont beaucoup plus perméables que la peau à l'eau et à de nombreuses substances. Les muqueuses digestives, sexuelles et respiratoires ou buccales possèdent des glandes sécrétant un mucus (substance liquide à visqueuse), comme les sécrétions nasales qui — dans les poumons — servent à empêcher les particules étrangères inhalées d'atteindre les parties profondes du poumon. Les muqueuses respiratoires et nasales sont aussi dotées respectivement de cils et de poils. Lorsque les micro-organismes arrivent à pénétrer l'organisme, ils se collent à la substance puis sont ingérés, détruits par des globules blancs ou rejetés par les cils et l'expectoration. Les caractéristiques cytologiques physiologiques des cellules des muqueuses sont les suivantes : le RER (réticulum endoplasmique rugueux) est bien développé et est responsable de la synthèse des glycoprotéines et des protéoglycanes du mucus ; l'appareil de Golgi est localisé en position supranucléaire et est également bien développé ; le cytoplasme est riche en vésicules de sécrétion ou grains de mucigène. Les colorations histologiques telles que le PAS, le mucicarmin et le bleu alcian mettent ces granulations de mucus en évidence.

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