Secondary metabolismSecondary metabolism (also called specialized metabolism) is a term for pathways and small molecule products of metabolism that are involved in ecological interactions, but are not absolutely required for the survival of the organism. These molecules are sometimes produced by specialized cells, such as laticifers in plants. Secondary metabolites commonly mediate antagonistic interactions, such as competition and predation, as well as mutualistic ones such as pollination and resource mutualisms.
Métabolites secondaires des plantesvignette|redresse=1.8|Diagramme représentant le métabolisme secondaire des plantes sous contraintes biotiques et abiotiques. Les métabolites secondaires des plantes sont des composés chimiques synthétisés par les plantes, c'est-à-dire des composés phytochimiques, qui remplissent des fonctions non essentielles, de sorte que leur absence n'est pas mortelle pour l'organisme, contrairement aux métabolites primaires. Les métabolites secondaires sont impliqués dans les interactions écologiques entre la plante et son environnement.
PlanctomycetotaLes planctomycètes ou Planctomycetota (anciennement Planctomycetes) forment un phylum de bactéries aquatiques, qui se trouvent dans des terrains saumâtres, marins ou d'eau douce, mais aussi de bactéries terrestres qui jouent un rôle important dans le processus anammox. Ils se reproduisent par bourgeonnement. La structure des organismes de ce groupe est ovoïde avec une tige, à la terminaison non-reproductive, qui les aide à se joindre les uns aux autres au cours du bourgeonnement.
PseudomonadotaLes Pseudomonadota – anciennement Proteobacteria (en français les Protéobactéries) – sont un vaste embranchement (ou division, ou phylum) du règne des Bacteria. C'est l'un des taxons bactériens les mieux caractérisés en raison de ses multiples recoupements avec la santé et les activités humaines.
PhototaxieLa phototaxie (ou le phototaxisme ou encore le phototactisme) est le phénomène par lequel des cellules corporelles, des bactéries ou d'autres organismes uni- ou pluricellulaires (plantes, champignons, animaux) se dirigent ou dirigent leurs mouvements en fonction de la lumière présente dans leur environnement. C’est l'un des types de taxie qui se distingue du phototropisme, phénomène de croissance dont l'orientation dépend de celle de la lumière. On parle de phototaxie positive lorsqu'il y a attirance, et de phototaxie négative lorsqu'il s'agit de répulsion.
Acide 1,3-bisphosphoglycériqueL’acide 1,3-bisphosphoglycérique — ou 1,3-bisphosphoglycérate sous forme déprotonée, abrégée en 1,3-BPG — est un composé organique présent dans le cytoplasme des cellules de tous les êtres vivants. Seul l'énantiomère 1,3-bisphospho-D-glycérate est biologiquement actif. Il intervient selon les cas comme métabolite de la glycolyse en relation avec la chaîne respiratoire ou comme intermédiaire du cycle de Calvin en relation avec la photosynthèse.
Phosphate de pyridoxalLe phosphate de pyridoxal (PLP) est une coenzyme dérivée d'une vitamine, la pyridoxine (vitamine ). C'est un groupement prosthétique. Il intervient dans le métabolisme en permettant entre autres la transamination ou la décarboxylation des acides aminés. Son site actif est la fonction aldéhyde sur l'atome de carbone 4. C'est une coenzyme des aminotransférases et des décarboxylases. La réaction de l'ALAT (alanine aminotransférase ou Glutamate pyruvate transaminase) est la suivante, montrant le rôle du coenzyme.
