Energy profile (chemistry)In theoretical chemistry, an energy profile is a theoretical representation of a chemical reaction or process as a single energetic pathway as the reactants are transformed into products. This pathway runs along the reaction coordinate, which is a parametric curve that follows the pathway of the reaction and indicates its progress; thus, energy profiles are also called reaction coordinate diagrams.
Parallel temperingParallel tempering, in physics and statistics, is a computer simulation method typically used to find the lowest energy state of a system of many interacting particles. It addresses the problem that at high temperatures, one may have a stable state different from low temperature, whereas simulations at low temperatures may become "stuck" in a metastable state. It does this by using the fact that the high temperature simulation may visit states typical of both stable and metastable low temperature states.
Dihydrogène (cation)Le cation dihydrogène, également appelé ion moléculaire d'hydrogène, est l'espèce chimique de formule . C'est l'ion moléculaire le plus simple, composé de deux hydrons unis par un unique électron. Il se forme notamment dans le milieu interstellaire sous l'effet du rayonnement cosmique : rayon cosmique → + e− + rayon cosmique résiduel Ce cation dihydrogène donne rapidement naissance au cation trihydrogène en interagissant avec une molécule d'hydrogène : → + H· présente un intérêt théorique en ce sens que, n'ayant qu'un seul électron, il permet de résoudre assez simplement l'équation de Schrödinger sans tenir compte de la corrélation électronique, ce qui en fait un sujet d'étude simple pour introduire la chimie quantique des molécules.
Contamination de spinEn chimie numérique, la 'contamination de spin' est le mélange artificiel de plusieurs états de spins électroniques. Ce mélange peut se produire lorsqu'une fonction d'onde basée sur une fonction orbitalaire approchée est représentée sous une forme non restreinte - c'est-à-dire que les parties spatiales des spinorbitales α et β peuvent différer. Les fonctions d'onde approchées avec un fort degré de contamination de spin ne sont pas souhaitées.
Helium atomA helium atom is an atom of the chemical element helium. Helium is composed of two electrons bound by the electromagnetic force to a nucleus containing two protons along with either one or two neutrons, depending on the isotope, held together by the strong force. Unlike for hydrogen, a closed-form solution to the Schrödinger equation for the helium atom has not been found. However, various approximations, such as the Hartree–Fock method, can be used to estimate the ground state energy and wavefunction of the atom.
Electronic structureIn physics, electronic structure is the state of motion of electrons in an electrostatic field created by stationary nuclei. The term encompasses both the wave functions of the electrons and the energies associated with them. Electronic structure is obtained by solving quantum mechanical equations for the aforementioned clamped-nuclei problem. Electronic structure problems arise from the Born–Oppenheimer approximation. Along with nuclear dynamics, the electronic structure problem is one of the two steps in studying the quantum mechanical motion of a molecular system.
John Lennard-JonesJohn Edward Lennard-Jones (, Leigh, Lancashire (actuellement Grand Manchester) - , Stoke-on-Trent, Staffordshire), est un physicien théoricien et chimiste théoricien anglais. Élu membre de la Royal Society en 1933. Titré chevalier commandeur de l'ordre de l'Empire britannique (KBE) en 1946. Médaille Davy de la Royal Society en 1953. Stephen G Brush, Lennard-Jones, John Edward, Dictionary of Scientific Biography 8 (1973), 185-187 Potentiel de Lennard-Jones Énergie potentielle Potentiel interatomique Catégori
Potentiel de Lennard-JonesLe potentiel de Lennard-Jones, qui est plus précisément une énergie potentielle, décrit l'interaction entre deux atomes au sein d'un gaz monoatomique de type gaz rare. Bien que ne faisant appel qu'à la seule distance entre deux centres il est également utilisé pour l'interaction de molécules. On peut alors l'interpréter comme potentiel moyen. Son expression en fonction de la distance r entre les deux atomes est : Le potentiel s'annule pour r = d et possède un minimum en r/d = 2 ≈ 1,12246....
Quantum Monte CarloQuantum Monte Carlo encompasses a large family of computational methods whose common aim is the study of complex quantum systems. One of the major goals of these approaches is to provide a reliable solution (or an accurate approximation) of the quantum many-body problem. The diverse flavors of quantum Monte Carlo approaches all share the common use of the Monte Carlo method to handle the multi-dimensional integrals that arise in the different formulations of the many-body problem.
PyMOLPyMOL est un logiciel libre de visualisation de structures chimiques en 3D créé par Warren DeLano. Il est principalement utilisé par les étudiants, les professeurs et les chercheurs en chimie et en biologie structurale. Il est développé en Python et est multiplateformes. Ainsi, il fonctionne sous Windows, Mac OS X, Linux et les systèmes Unix. Ce logiciel est régulièrement utilisé pour produire des images 3D de grande qualité pour la publication scientifique.
