OsmotrophieL'osmotrophie est un mode d'alimentation où l'organisme osmotrophe se nourrit à partir de substances dissoutes. La nutrition des organismes osmotrophes est assurée par échange transmembranaire, c'est-à-dire par diffusion d'ions ou de petites molécules au travers de la membrane cytoplasmique, selon un gradient osmotique. Ce type de nutrition, très répandu chez les micro-organismes, est également le fait d'un certain nombre d'animaux, libres ou parasites.
Pyramide écologiquevignette|Deux représentations rendant compte du fonctionnement d'un écosystème : pyramide écologique (a) et réseau trophique (b). La pyramide écologique est une forme de représentation graphique pour indiquer des rapports entre différentes catégories d'espèces correspondant à différents niveaux trophiques. Le premier maillon est les décomposeurs, puis les plantes autotrophes, les herbivores, les prédateurs primaires et les prédateurs secondaires, voire les prédateurs tertiaires (superprédateurs).
Métabolisme méthanogèneLes organismes à métabolisme méthanogène, ou simplement les méthanogènes, sont des micro-organismes qui produisent du méthane comme sous-produit métabolique de la vie en conditions anoxiques, par méthanogenèse. Le méthane est le produit final de leur respiration anaérobie. Certaines espèces peuvent néanmoins survivre un certain temps en présence de dioxygène. Ils étaient autrefois classés comme Archéobactéries ; mais celles-ci ont depuis été reclassées, les méthanogènes sont maintenant des Archées, un groupe de procaryotes distinct des bactéries.
Endolithevignette|Prélèvement de cyanobactéries endolithiques dans du granite.|alt=instruments d'échantillonnage de cyanobactéries dans des fissures de granit. Un endolithe est un organisme vivant au sein de roches, dans leurs pores, leurs fissures ou entre les grains minéraux qui la constituent, participant à la biométéorisation de ces roches dont il tire son alimentation. Les micro-organismes endolithiques peuvent être des archées, des bactéries et cyanobactéries, des microchampignons ou lichens, des algues voire des amibes.
BeggiatoaBeggiatoa is a genus of Gammaproteobacteria belonging to the order Thiotrichales, in the Pseudomonadota phylum. This genus was one of the first bacteria discovered by Ukrainian botanist Sergei Winogradsky. During his research in Anton de Bary's laboratory of botany in 1887, he found that Beggiatoa oxidized hydrogen sulfide (H2S) as an energy source, forming intracellular sulfur droplets, oxygen is the terminal electron acceptor and CO2 is used as a carbon source.
Microbial metabolismMicrobial metabolism is the means by which a microbe obtains the energy and nutrients (e.g. carbon) it needs to live and reproduce. Microbes use many different types of metabolic strategies and species can often be differentiated from each other based on metabolic characteristics. The specific metabolic properties of a microbe are the major factors in determining that microbe's ecological niche, and often allow for that microbe to be useful in industrial processes or responsible for biogeochemical cycles.
F-ratio (oceanography)In oceanic biogeochemistry, the f-ratio is the fraction of total primary production fuelled by nitrate (as opposed to that fuelled by other nitrogen compounds such as ammonium). The ratio was originally defined by Richard Eppley and Bruce Peterson in one of the first papers estimating global oceanic production. This fraction was originally believed significant because it appeared to directly relate to the sinking (export) flux of organic marine snow from the surface ocean by the biological pump.