Isolement (microbiologie)L'isolement est une technique qui permet de séparer les bactéries d'un échantillon en utilisant des milieux de culture solides, sélectifs ou non, pour les différencier. L'isolement permet d'obtenir des colonies différentes, espacées les unes des autres. On cherche à isoler les différentes cellules de l'échantillon, chaque cellule isolée étant alors potentiellement susceptible de conduire à une colonie (mais parfois on obtiendra des colonies mixtes difficilement résolubles ...). L'isolement permet d'observer les colonies.
Robert KochRobert Koch (en allemand : , à Clausthal, Royaume de Hanovre - à Baden-Baden, Empire allemand) est un médecin allemand connu pour sa découverte de la bactérie responsable de la tuberculose qui porte aujourd'hui son nom : « bacille de Koch ». Les travaux qu'il mène pour la découvrir lui valent le prix Nobel de physiologie ou médecine de 1905. C'est l'un des fondateurs de la bactériologie.
Fungivignette|La présence de sporophores en console du Polypore amadouvier sur le volis et la chandelle d'un hêtre montre que ce dernier a été attaqué par ce champignon nécrotrophe lignicole à l'origine de la pourriture blanche qui creuse le cœur de l'arbre qu'il parasite en le faisant mourir d'épuisement. La poursuite du développement de ce macromycète sur le volis entraîne une modification rapide de l'orientation de la « fructification » en croissance, afin de pouvoir projeter les spores fongiques dans les conditions optimales.
PseudomonasLes bactéries du genre Pseudomonas peuvent être définies par : Bacilles à Gram négatif, oxydase + ; Aérobies stricts (« Respiration nitrate » chez certaines espèces) ; Dégradant le glucose par respiration aérobie ou inerte vis-à-vis du glucose. Ils n'attaquent pas les sucres ou les attaquent par voie oxydative et non fermentative ; Généralement mobiles par ciliature polaire (monotriche ou lophotriche) ; Peu exigeantes, cultivant de ; Indole - ; Asporulés ; Colonies souvent pigmentées.
Violet de gentianeLe nom violet de gentiane est le nom commun donné au mélange de méthyl violets 2B, 6B et 10B selon que la molécule contient 4, 5 ou 6 groupements méthyle. On appelle parfois cristal violet ou violet de Paris le méthyl violet 10B, tandis que le méthyl violet 2B est connu en tant que violet de méthyle. C'est un colorant de couleur violette, d'autant plus foncée que le nombre de groupements méthyle augmente, utilisé surtout en microbiologie : dans la coloration de Gram ; dans certains milieux sélectifs (par exemple, dans la gélose de Drigalski comme inhibiteur des bactéries à Gram positif).
Streptococcus pyogenesStreptococcus pyogenes, également appelée streptocoque du groupe A, est une bactérie responsable d'infections potentiellement graves chez l'Homme, à l'origine d'un demi-million de morts par an dans le monde. Elle appartient au genre Streptococcus. Il s'agit de cocci à Gram positif se présentant sous forme de chaînettes. Ils sont dépourvus de catalase et d'oxydase et sont anaérobies préférentiels aérotolérants. Sur gélose au sang, ils développent une large zone d'hémolyse complète (= hémolyse de type bêta).
CorynebacteriumCorynebacterium (en français les Corynébactéries) sont un genre de bacilles Gram positif de la famille des Corynebacteriaceae. Ces bactéries sont très répandues dans l'environnement (air, sol, eau douce), chez l'animal (volailles, poissons) et l'être humain où elles abondent dans le microbiote cutané et dans certaines muqueuses. Ces bactéries sont de forme irrégulière, en général de forme renflée à une extrémité (en massue). Leur mode de groupement particulier (en V, N, L ou en idéogrammes, en palissades) témoigne de leur division par fission binaire inégale.
Milieu LBLe milieu de culture LB (Pour lysogeny broth ou incorrectement milieu Luria-Bertani) est un milieu de culture nutritif, servant initialement à la culture bactérienne. Il a été d'abord développé par Bertani, qui le nomma lysogeny broth (bouillon lysogène) dans sa première publication. Les milieux LB sont devenus un standard dans l'industrie pour la culture d'Escherichia coli, depuis les années 1950. Ils ont été fortement utilisés en microbiologie moléculaire pour la préparation de plasmides d'ADN et de protéines recombinantes.
TryptoneTryptone is the assortment of peptides formed by the digestion of casein by the protease trypsin. Tryptone is commonly used in microbiology to produce lysogeny broth (LB) for the growth of E. coli and other microorganisms. It provides a source of amino acids for the growing bacteria. Tryptone is similar to casamino acids, both being digests of casein, but casamino acids can be produced by acid hydrolysis and typically only have free amino acids and few peptide chains; tryptone by contrast is the product of an incomplete enzymatic hydrolysis with some oligopeptides present.
Gélose nutritivevignette|Gélose nutritive pour la culture de bactéries Escherichia coli En biologie, la gélose nutritive ou gélose nutritive ordinaire (GNO) ou encore gélose ordinaire est un milieu d'isolement non sélectif. L'isolement est réalisé dans le but de contrôler la pureté d'une souche bactérienne (pur s'il y a un type de colonie sur la gélose) ou de purifier la souche bactérienne si elle est contaminée. L'isolement permet de séparer des microorganismes différents dans un mélange qui pourront être ainsi étudiés individuellement.