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Un modèle moléculaire est un modèle physique qui représente des molécules et leurs processus. Dans cet article, le "modèle moléculaire" fera principalement référence aux systèmes contenant plus d'un atome et où la structure nucléaire est négligée. La structure électronique est également souvent omise ou représentée de manière très sophistiquée. Les modèles physiques des systèmes atomistiques ont joué un rôle important dans la compréhension de la chimie et dans la génération et la vérification d'hypothèses. Le plus souvent, il existe une représentation explicite des atomes, bien que d'autres approches telles que les films de savon et d'autres supports aient été utilisés. Il existe plusieurs raisons quant à la création de modèles physiques : en tant qu'outils pédagogiques pour les étudiants ou ceux qui ne connaissent pas les structures atomistiques; pour générer ou tester des théories (par exemple, la structure de l'ADN); en tant qu'ordinateurs analogiques (par exemple, pour mesurer les distances et les angles dans les systèmes flexibles) ; comme objets esthétiques à la frontière de l'art et de la science. La construction de modèles physiques est un acte souvent créatif, et de nombreux exemples sur mesure ont été soigneusement créés dans les départements scientifiques. Il existe un très large éventail d'approches de la modélisation physique des molécules, et cet article ne répertorie que les plus courantes ou historiquement les plus importantes. La stratégie principale, initialement dans les manuels et les articles de recherche et plus récemment sur les ordinateurs. Les graphiques moléculaires ont remplacé certaines fonctions des modèles moléculaires physiques, mais les kits physiques continuent d'être très populaires et sont vendus en grand nombre. Leurs atouts uniques : le prix: bon marché et portabilité messages immédiats de manière tactile et visuel interactivité simple pour de nombreux processus (par exemple, analyse conformationnelle et pseudorotation).
Alfredo Pasquarello, Chunmin Zhang, Assil Bouzid, Yiming Chen