Algorithmes d'intégration pour la dynamique moléculaire: Algorithme de Verlet

Cette séance de cours couvre les algorithmes d'intégration pour la dynamique moléculaire, en se concentrant sur l'algorithme de Verlet. Il explique la méthode Position Verlet, Velocities avec Verlet, Leap-frog Verlet et Velocity Verlet. La séance de cours détaille les avantages de l'algorithme Position Verlet et discute de la précision et de l'ordre des calculs de vitesse. Des exemples, tels que l'oscillateur harmonique, sont utilisés pour illustrer les concepts. En outre, la méthode Leap-Frog Verlet est expliquée, montrant son équivalence avec l'algorithme Position Verlet. L'algorithme Velocity Verlet est également présenté, mettant en évidence sa séquence et son équivalence avec la méthode Position Verlet.