Êtes-vous un étudiant de l'EPFL à la recherche d'un projet de semestre?
Travaillez avec nous sur des projets en science des données et en visualisation, et déployez votre projet sous forme d'application sur Graph Search.
Cette séance de cours couvre l'analyse des génotypes et des variantes d'informations extraites des données openSNP, en se concentrant sur la conduite d'une étude d'association à l'échelle du génome (GWAS) pour explorer l'association entre les variantes génétiques et les phénotypes comme la hauteur. La séance de cours comprend l'exploration de données, des méthodes statistiques pour évaluer l'impact des covariables sur les phénotypes, la modélisation de régression linéaire et des techniques de visualisation telles que les parcelles de Manhattan. Les élèves apprendront à exécuter GWAS avec et sans covariables, interpréter les valeurs de p, comparer les résultats et mener une méta-analyse avec les données de l'étude GIANT.