Génomique : réseaux d'introduction et de réglementation

Cette séance de cours couvre les bases de la génomique, y compris les technologies de séquençage, la variation du génome et les études d'association à l'échelle du génome. Il se penche également sur l'histoire de la génomique, mettant en lumière des personnalités clés telles que James Watson, Walter Gilbert et David Botstein. La séance de cours explore en outre les cartes de liaison génétique humaine, les méthodes RFLP et le concept de cartographie génétique à l'aide de marqueurs. La discussion s'étend à la détection de séquences d'ADN spécifiques par Southern blot et à l'importance des cartes génétiques dans la compréhension de l'ordre des gènes et des fréquences de recombinaison.

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Séances de cours associées (47)

Concepts associés (46)

BIO-373: Genetics and genomics

The theoretical part of this course covers classical genetics and contemporary genomics. Because bioinformatics has become important for genomic research, the course also includes practical applicatio

Cartographie génétique

alt=Genetic Difference|vignette|Cartographie génétique du monde selon les légères différences de locus La cartographie génétique est la construction d’une carte soit localisée autour d’un gène, soit à base large portant sur le génome entier. Plus généralement, c’est la détermination de la position d’un locus (gène ou marqueur génétique) sur un chromosome en fonction du taux de recombinaison génétique. Son unité de distance est le centimorgan (cM).

Séquençage shotgun

En génétique, le séquençage shotgun (littéralement séquençage "fusil de chasse") est une méthode utilisée pour séquencer des brins d'ADN aléatoires. On l'appelle ainsi par analogie avec le modèle de tir quasi-aléatoire en pleine expansion d'un fusil de chasse : cette métaphore illustre le caractère aléatoire de la fragmentation initiale de l'ADN génomique où l'on "arrose" tout le génome, un peu comme se dispersent les plombs de ce type d'arme à feu.

Exome sequencing

Exome sequencing, also known as whole exome sequencing (WES), is a genomic technique for sequencing all of the protein-coding regions of genes in a genome (known as the exome). It consists of two steps: the first step is to select only the subset of DNA that encodes proteins. These regions are known as exons—humans have about 180,000 exons, constituting about 1% of the human genome, or approximately 30 million base pairs. The second step is to sequence the exonic DNA using any high-throughput DNA sequencing technology.

Sanger sequencing

Sanger sequencing is a method of DNA sequencing that involves electrophoresis and is based on the random incorporation of chain-terminating dideoxynucleotides by DNA polymerase during in vitro DNA replication. After first being developed by Frederick Sanger and colleagues in 1977, it became the most widely used sequencing method for approximately 40 years. It was first commercialized by Applied Biosystems in 1986. More recently, higher volume Sanger sequencing has been replaced by next generation sequencing methods, especially for large-scale, automated genome analyses.

Séquençage

En biochimie, le séquençage consiste à déterminer l'ordre linéaire des composants d'une macromolécule (les acides aminés d'une protéine, les nucléotides d'un acide nucléique comme l'ADN, les monosaccharides d'un polysaccharide, etc.). En génétique, le séquençage concerne la détermination de la séquence des gènes voire des chromosomes, voire du génome complet, ce qui techniquement revient à effectuer le séquençage de l'ADN constituant ces gènes ou ces chromosomes.

L’auto-attraction de l’ADN : interactions médiées PHYS-441: Statistical physics of biomacromolecules

Discute de l'auto-attraction de l'ADN et de ses interactions médiées.

Exploration des gènes et des génomes CH-210: Biochemistry

Explore la structure des protéines, l'analyse de l'ADN, le séquençage des gènes et le projet du génome humain.

ADN: PCR et techniques de séquençage MSE-212: Biology for engineers

Explore l'ingénierie de l'ADN à travers la PCR, le séquençage Sanger, le projet du génome humain, l'ADN recombinant, la manipulation de l'ADN bactérien et CRISPR / Cas9.

Médecine personnalisée : Variabilité génétique et réponse aux médicaments BIO-480: Neuroscience: from molecular mechanisms to disease

Explore la médecine personnalisée, la variabilité génétique et la réponse aux médicaments, en mettant l'accent sur l'adaptation des traitements en fonction des profils génétiques et métaboliques individuels.

Réplication de l'ADN et applications MSE-212: Biology for engineers

Explore la réplication de l'ADN, la PCR, les techniques de séquençage, les applications de l'ADN synthétique, les systèmes d'administration de médicaments, l'origami de l'ADN et l'ingénierie tissulaire.