Protéomique quantitative : techniques et applications

Cette séance de cours traite des principes et des méthodologies de la protéomique quantitative, en soulignant l'importance de la quantification dans les systèmes biologiques. L'instructeur commence par souligner la nécessité de mesurer quantitativement les phénomènes biologiques, en référence à l'affirmation de Galileo selon laquelle la science doit être quantitative. Différents types de quantification sont introduits, y compris la quantification relative, qui mesure les rapports entre les échantillons, et la quantification absolue, qui fournit des unités physiques comme les moles ou les concentrations. La séance de cours explique comment l'intensité du signal de la spectrométrie de masse est utilisée pour dériver des quantités de protéines. Diverses stratégies d'étiquetage pour la protéomique quantitative sont également couvertes, y compris l'étiquetage métabolique à l'aide d'isotopes et de méthodes d'étiquetage chimique. L'instructeur détaille comment ces techniques permettent la comparaison d'échantillons en analysant des peptides chimiquement identiques mais distinguables par la masse. Cette approche permet aux chercheurs d'obtenir une quantification relative en calculant des rapports d'intensités peptidiques à partir de différents échantillons, facilitant ainsi une compréhension plus profonde de l'abondance des protéines dans des contextes biologiques.