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Cette séance de cours porte sur l'utilisation de la spectrométrie de masse pour le profilage des protéines, en mettant l'accent sur les approches ascendantes et descendantes. Il explique le processus de digestion des protéines, l'analyse des peptides et l'identification des structures protéiques. En outre, il traite des techniques d'enrichissement cible telles que le retrait d'affinité et le retrait de biotine-streptavidin, ainsi que l'application de la chimie du couplage de clics. La séance de cours introduit également l'étiquetage isotopique stable pour la protéomique quantitative et le protocole SILAC pour identifier les interactions de petites molécules avec les protéines.