Quantification et identification des protéines en spectrométrie de masse

Cette séance de cours couvre les défis de la quantification des protéines à l'aide de la spectrométrie de masse, y compris l'impact de l'efficacité de l'ionisation sur l'intensité maximale et la complexité de la mesure de l'abondance des analytes. Il discute également des techniques comme la quantification sans étiquette, SILAC et TMT pour comparer les niveaux de peptide entre les échantillons. La séance de cours se penche sur les principes du comptage spectral, les peptides AQUA pour la quantification absolue et l'utilisation du mélange Super SILAC comme standard interne. En outre, il explore le rôle d'UniprotKB dans la fourniture d'informations fonctionnelles sur les protéines et le processus de recherche d'ions MS / MS à l'aide de listes de pointe. L'importance des tolérances de masse, de la sélection des enzymes et de la recherche précise dans les bases de données est soulignée.