Publication

Identifying Mixtures of Isomeric Human Milk Oligosaccharides by the Decomposition of IR Spectral Fingerprints

Résumé

The analysis of glycans presents a significant challenge that arises from their isomeric heterogeneity. While high-resolution ion mobility spectrometry (IMS) has shown the ability to resolve subtly different glycan isomers, their unambiguous assignment remains difficult. Here, we demonstrate an infrared (IR) spectroscopic approach for identifying isomers in a glycan mixture. To display the feasibility of this approach, we have constructed a small database of cryogenic spectra of five lacto-N- fucopentaose (LNFP) and six disaccharide isomers and demon- strated that in the cases where they cannot be separated by IMS, we can use a cryogenic IR spectrum to identify the isomeric components of a mixture.

À propos de ce résultat
Cette page est générée automatiquement et peut contenir des informations qui ne sont pas correctes, complètes, à jour ou pertinentes par rapport à votre recherche. Il en va de même pour toutes les autres pages de ce site. Veillez à vérifier les informations auprès des sources officielles de l'EPFL.
Concepts associés (33)
Glucose
Les glucoses sont des sucres de formule brute . Le mot « glucose » provient du grec ancien τὸ γλεῦκος / gleukos qui désignait les vins doux ou liquoreux, voire le moût. Le suffixe -ose est un classificateur chimique précisant qu'il s'agit d'un glucide. Comme il ne peut être hydrolysé en glucides plus simples, il s'agit d'un ose, ou monosaccharide. La présence d'un groupe carbonyle de fonction aldéhyde dans sa forme linéaire en fait un aldose tandis que ses six atomes de carbone en font un hexose ; il s'agit par conséquent d'un aldohexose.
Ose
Un ose (ou monosaccharide) est un monomère de glucide. Les oses possèdent au moins trois atomes de carbone : ce sont des polyhydroxyaldéhydes ou des polyhydroxycétones. Les monosaccharides ne sont pas hydrolysables, mais les polysaccharides sont très solubles dans l'eau et possèdent généralement un pouvoir sucrant.
Glycane
Un glycane est un polymère composé de monosaccharides reliés entre eux par une liaison glycosidique. Chez les bactéries et toutes les espèces vivantes, sous forme d'oligo ou de polysaccharides attachés à des glycolipides et glycoprotéines, ils jouent un rôle fondamental dans les membranes cellulaires et la communication intercellulaire. Ils sont une partie importante du glycome. Ils jouent un rôle important dans la cellule pour le bon repliement des protéines dans le réticulum endoplasmique, via les protéines chaperons.
Afficher plus
Publications associées (44)

Combining ion mobility spectrometry and cryogenic ion spectroscopy with enzymatic digestion/synthesis for the study of N-linked glycans

Irina Märki

Glycans play an essential role in numerous physiological and pathological processes of living organisms. Despite their significant biological relevance, glycobiology remains one of the least explored fields of biochemistry. The intrinsic isomeric complexit ...
EPFL2023

Advancing Glycan Analysis: Cryogenic Ion Spectroscopy for Database-Driven Identification

Ali H Abikhodr

Glycans play a pivotal role in both physiological processes; however, the field of glycobiology remains relatively understudied within biochemistry. The intricate complexity of glycans, coupled with their abundance of isomeric forms, presents formidable ch ...
EPFL2023

New Approach for the Identification of Isobaric and Isomeric Metabolites

Thomas Rizzo, Ahmed Ben Faleh, Stephan Warnke, Ali H Abikhodr, Teun Van Wieringen

The structural elucidation of metabolite molecules is important in many branches of the life sciences. However, the isomeric and isobaric complexity of metabolites makes their identification extremely challenging, and analytical standards are often require ...
AMER CHEMICAL SOC2023
Afficher plus
MOOCs associés (4)
Fundamentals of Biomedical Imaging: Ultrasounds, X-ray, positron emission tomography (PET) and applications
Learn how principles of basic science are integrated into major biomedical imaging modalities and the different techniques used, such as X-ray computed tomography (CT), ultrasounds and positron emissi
Fundamentals of Biomedical Imaging: Ultrasounds, X-ray, positron emission tomography (PET) and applications
Learn how principles of basic science are integrated into major biomedical imaging modalities and the different techniques used, such as X-ray computed tomography (CT), ultrasounds and positron emissi
Fundamentals of Biomedical Imaging: Magnetic Resonance Imaging (MRI)
Learn about magnetic resonance, from the physical principles of Nuclear Magnetic Resonance (NMR) to the basic concepts of image reconstruction (MRI).
Afficher plus

Graph Chatbot

Chattez avec Graph Search

Posez n’importe quelle question sur les cours, conférences, exercices, recherches, actualités, etc. de l’EPFL ou essayez les exemples de questions ci-dessous.

AVERTISSEMENT : Le chatbot Graph n'est pas programmé pour fournir des réponses explicites ou catégoriques à vos questions. Il transforme plutôt vos questions en demandes API qui sont distribuées aux différents services informatiques officiellement administrés par l'EPFL. Son but est uniquement de collecter et de recommander des références pertinentes à des contenus que vous pouvez explorer pour vous aider à répondre à vos questions.