Inferring horizontal gene transferHorizontal or lateral gene transfer (HGT or LGT) is the transmission of portions of genomic DNA between organisms through a process decoupled from vertical inheritance. In the presence of HGT events, different fragments of the genome are the result of different evolutionary histories. This can therefore complicate investigations of the evolutionary relatedness of lineages and species. Also, as HGT can bring into genomes radically different genotypes from distant lineages, or even new genes bearing new functions, it is a major source of phenotypic innovation and a mechanism of niche adaptation.
Species distribution modellingSpecies distribution modelling (SDM), also known as environmental (or ecological) niche modelling (ENM), habitat modelling, predictive habitat distribution modelling, and range mapping uses computer algorithms to predict the distribution of a species across geographic space and time using environmental data. The environmental data are most often climate data (e.g. temperature, precipitation), but can include other variables such as soil type, water depth, and land cover.
Microbial population biologyMicrobial population biology is the application of the principles of population biology to microorganisms. Microbial population biology, in practice, is the application of population ecology and population genetics toward understanding the ecology and evolution of bacteria, archaebacteria, microscopic fungi (such as yeasts), additional microscopic eukaryotes (e.g., "protozoa" and algae), and viruses. Microbial population biology also encompasses the evolution and ecology of community interactions (community ecology) between microorganisms, including microbial coevolution and predator-prey interactions.
Seaweed farmingSeaweed farming or kelp farming is the practice of cultivating and harvesting seaweed. In its simplest form farmers gather from natural beds, while at the other extreme farmers fully control the crop's life cycle. The seven most cultivated taxa are Eucheuma spp., Kappaphycus alvarezii, Gracilaria spp., Saccharina japonica, Undaria pinnatifida, Pyropia spp., and Sargassum fusiforme. Eucheuma and K. alvarezii are attractive for carrageenan (a gelling agent); Gracilaria is farmed for agar; the rest are eaten after limited processing.
Projet microbiote humainLe projet microbiote humain (en anglais, Human Microbiome Project ou HMP) est une initiative des National Institutes of Health (NIH) américains dont le but est d'identifier et de caractériser l'ensemble des micro-organismes qui vivent en association avec les humains, le microbiote. Lancé en 2008, ce projet de cinq ans, d'un budget total de $115 millions, avait pour but de découvrir les liens entre l'état de santé et les maladies d'une part et le microbiote des personnes impliquées dans cette étude.
Deep chlorophyll maximumThe deep chlorophyll maximum (DCM), also called the subsurface chlorophyll maximum, is the region below the surface of water with the maximum concentration of chlorophyll. The DCM generally exists at the same depth as the nutricline, the region of the ocean where the greatest change in the nutrient concentration occurs with depth. A DCM is not always present - sometimes there is more chlorophyll at the surface than at any greater depth - but it is a common feature of most aquatic ecosystems, especially in regions of strong thermal stratification.
BdelloidaLes Bdelloidea (les bdelloïdes en français) sont une sous-classe de l'embranchement des rotifères. Les rotifères bdelloïdes sont des organismes microscopiques, dont la longueur varie entre 150 et 700 μm. La plupart sont trop petits pour être visibles à l’œil nu, mais peuvent être observés à l'aide d'une simple lentille grossissante. thumb|300px|Vues prises au microscope électronique montrant la variation morphologique des rotifères bdelloides et de leurs « mâchoires ».
Polyphyliethumb|334px|Le groupe des « animaux à sang chaud » est polyphylétique. Un groupe polyphylétique est un assemblage d'organismes excluant leur ancêtre commun le plus récent. Un tel groupe est le plus souvent défini par une ressemblance qui n'a pas été héritée d'un ancêtre commun. Ce terme désigne donc des groupes qui n'ont aucune pertinence pour retracer les liens de parenté et donc l'évolution.
MultiomiqueLa multiomique est une discipline de la biotechnologie alliant les dernières avancées et analyses des champs de recherche de la génomique, de la métabolomique, de la transcriptomique et de la protéomique. Elle est parfois aussi appelée: omique intégrative, panomique ou pan-omique. Le terme peut être décrit comme une approche d'analyse biologique dans laquelle les ensembles de données sont des « omes » multiples, tels que le génome, le protéome, le transcriptome, l'épigénome, le métabolome et le microbiome (c'est-à-dire un métagénome et/ou un métatranscriptome, selon la manière dont il est séquencé) en d'autres termes, l'utilisation de multiples technologies omiques pour étudier la vie de manière croisée.
Espèce menacéeThreatened species are any species (including animals, plants and fungi) which are vulnerable to extinction in the near future. Species that are threatened are sometimes characterised by the population dynamics measure of critical depensation, a mathematical measure of biomass related to population growth rate. This quantitative metric is one method of evaluating the degree of endangerment.