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En anatomie, le cou est, chez un certain nombre de vertébrés, la région du corps qui est située entre la tête et le thorax. Le cou a plusieurs fonctions : il soutient et donne à la tête sa mobilité, laisse passage à plusieurs éléments viscéraux du système nerveux, des appareils digestif, ventilatoire et phonatoire, permet la vascularisation de la tête et joue un rôle dans le métabolisme général et phosphocalcique. Anatomie du cou humain vignette|Les muscles superficiels du cou. Face latérale vignette|Les muscles superficiels du cou. Face ventrale vignette|Anatomie du cou selon Léonard de Vinci Schématiquement, on distingue deux parties dans le cou. La partie antérieure, appelée « gorge » dans le langage courant, est constituée de tissu mou et contient des éléments viscéraux digestifs, ventilatoires et phonatoires (une partie du pharynx et de l’œsophage, le larynx, une partie de la trachée) et endocriniens (la thyroïde et les parathyroïdes). Elle comporte également une ga

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Multi-Atlas based Segmentation of Head and Neck CT Images using Active Contour Framework

Meritxell Bach Cuadra, Jean-Philippe Thiran, Subrahmanyam Venkata Ravi Mohana Sai Gorthi

This paper presents the segmentation of bilateral parotid glands in the Head and Neck (H&N) CT images using an active contour based atlas registration. We compare segmentation results from three atlas selection strategies: (i) selection of “single-most-similar” atlas for each image to be segmented, (ii) fusion of segmentation results from multiple atlases using STAPLE, and (iii) fusion of segmentation results using majority voting. Among these three approaches, fusion using majority voting provided the best results. Finally, we present a detailed evaluation on a dataset of eight images (provided as a part of H&N auto segmentation challenge conducted in conjunction with MICCAI-2010 conference) using majority voting strategy.

2010

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Evaluation of Atlas Fusion Strategies for Segmentation of Head and Neck Lymph Nodes for Radiotherapy Planning

Meritxell Bach Cuadra, Jean-Philippe Thiran, Subrahmanyam Venkata Ravi Mohana Sai Gorthi

Accurate segmentation of lymph nodes in head and neck (H&N) CT images is essential for the radiotherapy planning of the H&N cancer. Atlas-based segmentation methods are widely used for the automated segmentation of such structures. Multi-atlas approaches are proven to be more accurate and robust than using a single atlas. We have recently proposed a general Markov random field (MRF)-based framework that can perform edge-preserving smoothing of the labels at the time of fusing the labels itself. There are three main contributions of this paper: First, we reformulate the "shape based averaging" (SBA) fusion method to fit into the general MRF-based fusion framework. Second, we evaluate the following fusion algorithms for the segmentation of H&N lymph nodes: (i) STAPLE, (ii) SBA, (iii) SBA+MRF, (iv) majority voting (MV), (v) MV+MRF, (vi) global weighted voting (GWV), (vii) GWV+MRF, (viii) local weighted voting (LWV) and (ix) LWV+MRF. Finally, we also study the effect varying the number of atlases on the performance of the above algorithms.

Ieee2012

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Gait-dependent integration of neck muscle afferent input

Grégoire Courtine

We investigated the integration of neck muscle afferents during walking and running. Subjects walked or ran straight ahead, with or without an additional mass (20% of body weight). They performed all trials without vibration and with continuous vibration (80 Hz) applied to the lateral aspect of the neck. Vibration systematically caused body deviation toward the side opposite to the stimulation. The amplitude of vibration-induced body deviations was dramatically larger for walking (21.6 +/- 4.6 degrees ) than for running (8.0 +/- 2.5 degrees ). The additional mass marginally straightened body trajectory (average 5.6%), indicating that the gait-dependent effect of neck vibration cannot solely be attributed to differences in body inertia between walking and running. We concluded that neck muscle afferences are selectively gated according to the gait performed

2003

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BIO-482: Neuroscience: cellular and circuit mechanisms

This course focuses on the cellular mechanisms of mammalian brain function. We will describe how neurons communicate through synaptic transmission in order to process sensory information ultimately leading to motor behavior.

BIO-373: Genetics and genomics

The theoretical part of this course covers classical genetics and contemporary genomics. Because bioinformatics has become important for genomic research, the course also includes practical applications to genomic analyses using Python, including group projects.

BIOENG-456: Controlling behavior in animals and robots

Students will acquire an integrative view on biological and artificial algorithms for controlling autonomous behaviors in animals and robots. Students will synthesize and apply this knowledge in oral presentations and exercises.

Vertèbre

Une vertèbre est un os constituant la colonne vertébrale chez les animaux vertébrés. Chez l'humain, on compte vingt-quatre vertèbres indépendantes et huit à dix vertèbres soudées (cinq sacrales et

Artère carotide commune

vignette|Arc aortique avec ses collatérales. On observe les deux origines des artères carotides communes droite et gauche. En anatomie humaine, l'artère carotide commune (arteria carotis communis), an

Moelle spinale

La moelle spinale (selon la nouvelle nomenclature), ou moelle épinière (dans l’ancienne nomenclature), désigne la partie du système nerveux central qui prolonge la moelle allongée appartenant au