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Cette séance de cours couvre le calcul des états d'énergie des protéines en fonction de la température, des différences d'énergie et des distances moléculaires. Il traite également de la relation entre l'énergie de liaison covalente, la force et la distance interatomique, ainsi que de l'impact des charges sur l'énergie des ponts salés. En outre, il explore l'influence des angles dièdres sur l'énergie des chaînes latérales et l'utilisation de formules pour approximer les interactions de van der Waals. La stabilité des conformations protéiques dans différents environnements et les facteurs à l'origine des réactions de repliement des protéines sont également abordés.