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Explore la conservation de l'énergie totale dans des systèmes avec une énergie potentielle indépendante du temps, démontrant sa constance et son importance dans la vérification de la précision de l'intégration numérique.
Couvre les bases des simulations de dynamique moléculaire, des propriétés d'ensemble, des formulations de mécanique classique, de l'intégration numérique, de la conservation de l'énergie et des algorithmes de contrainte.
Explore les tendances et les défis de la modélisation de systèmes moléculaires complexes à l'aide d'approches hiérarchiques à plusieurs échelles, couvrant les échelles de durée, les simulations atomistes et les techniques d'appariement des forces.
Explore les simulations QM/MM à l'aide de la théorie de l'ensemble Blue Moon, en se concentrant sur l'analyse des erreurs, le redimensionnement de masse ionique, la comparaison de stabilité et le contrôle de la température.
Explore des simulations informatiques en biologie cellulaire, en se concentrant sur la dynamique moléculaire et Monte Carlo, pour mieux comprendre les systèmes biologiques complexes et leurs limites.