Conception de protéines computationnelles: principes et défis

Cette séance de cours présente le domaine de la conception de protéines computationnelles, en soulignant son importance dans la bioingénierie et la biologie synthétique. L'instructeur décrit les défis associés à la prédiction et à la conception de la structure des protéines, en se concentrant sur les éléments fondamentaux de la structure et des interactions protéiques. Les sujets clés comprennent les fonctions de notation pour la sélection des structures protéiques et les techniques d'échantillonnage pour trouver des configurations optimales. La séance de cours traite de l'importance des protéines en tant que macromolécules essentielles dans les cellules vivantes, en soulignant leur rôle dans la catalyse des réactions et la régulation des fonctions cellulaires. L'instructeur explique diverses stratégies pour la conception de protéines, y compris la réingénierie des protéines naturelles et la conception de novo de nouvelles protéines. Les complexités de la conception des protéines sont abordées, en particulier le vaste espace conformationnel et les défis informatiques impliqués dans la prédiction des structures protéiques. La séance de cours se termine par un aperçu des fonctions énergétiques et des techniques de recherche nécessaires à une conception efficace des protéines, ouvrant la voie à des applications pratiques lors des sessions suivantes.