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Couvre les principes fondamentaux et les applications des simulations à gros grains, y compris les avantages, les défis, les simulations à une seule échelle, les techniques de modélisation du cerveau et les membranes lipidiques à gros grains.
Explore l'échantillonnage de la dynamique moléculaire, les lois de conservation, les fluctuations d'énergie et divers thermostats utilisés pour les simulations.
Explore des simulations informatiques en biologie cellulaire, en se concentrant sur la dynamique moléculaire et Monte Carlo, pour mieux comprendre les systèmes biologiques complexes et leurs limites.
Résume les approximations de gradient généralisées, les méta-GGA, les fonctions hybrides, la dynamique moléculaire des premiers principes, les simulations QM / MM et les caractéristiques importantes des calculs de chimie quantique.
Couvre la simulation MD de la miniprotéine Trp-cage, en mettant l'accent sur la modélisation implicite des solvants et l'analyse pratique des résultats de simulation.
Couvre les champs de force classiques, les simulations de dynamique moléculaire et les propriétés supramoléculaires, y compris les interactions intramoléculaires et intermoléculaires.
