Protein Structure Prediction

Cette séance de cours se concentre sur la prédiction de la structure des protéines en analysant le contact entre les acides aminés. L'instructeur explique l'importance de l'alignement de séquences multiples, de la matrice de covariance, des informations mutuelles et de l'analyse de couplage direct (DCA). La mise en œuvre du champ moyen DCA est mise en évidence pour sa rapidité et sa précision dans la prédiction des contacts protéiques. La séance de cours couvre également l'utilisation de la modélisation de l'entropie maximale, de la méthode de pseudo-vraisemblance et des techniques de régularisation pour améliorer la prédiction des contacts dans les protéines.