Séance de cours
Protein Structure Prediction
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Pliage des protéines: structure et conception
Explore le repliement des protéines, les interactions hydrophobes, les conformations compactes, le modèle HP, la co-évolution et les méthodes de calcul.
Conception des protéines: Structure et fonction
Couvre les fondamentaux de la conception des protéines, y compris les structures secondaires, la propension aux acides aminés, les boucles et les méthodes de calcul.
Acides aminés et structures protéiques
Introduit des acides aminés, des structures protéiques et des matériaux naturels à base de protéines comme la soie et le collagène.
Conception des protéines: Méthodes de calcul
Couvre les défis de la conception des protéines, des fonctions énergétiques, des algorithmes de recherche et des applications en biologie synthétique, en soulignant l'importance de la conception des protéines et les méthodes utilisées pour la conception des protéines.
Polymères de protéines: Biophysics Insights
Se penche sur les polymères protéiques, discutant de la co-évolution, de la diffusion, des structures protéiques et des méthodes expérimentales.
Protein Structure Prediction
Explore la prédiction de la structure des protéines à partir des données de séquence en utilisant la modélisation de l'entropie maximale et discute des progrès récents dans la prédiction de la structure des protéines.
Structure de séquence de peptide
Enseigne comment écrire des séquences peptidiques correctement en utilisant une méthode de ligne en zigzag simple et souligne l'importance de respecter la stéréochimie pour éviter les erreurs.
Analyse co-évolutionnaire des protéines
Explore l'analyse co-évolutionnaire des protéines, couvrant les fonctions protéiques, le pliage, les corrélations, le DCA et les outils de prédiction de la structure comme AlphaFold 2.
Biophysique: Pliage des polymères et organisation de l'ADN
Explore le pliage des polymères, les interactions hydrophobes et l'organisation de l'ADN, en soulignant leur importance biologique.
Prédiction de la structure protéique : AlphaFold Evolution et OpenFold Insights
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