Couvre les bases des simulations de dynamique moléculaire, des propriétés d'ensemble, des formulations de mécanique classique, de l'intégration numérique, de la conservation de l'énergie et des algorithmes de contrainte.
Explore les transformations canoniques, les groupes symplectiques, les matrices réelles, les quantités préservées et les volumes dans l'espace de phase.
Explore les simulations de dynamique moléculaire sous des contraintes holonomiques, en se concentrant sur l'intégration numérique et la formulation d'algorithmes.
Explore la rigidité symlectique, y compris la rigidité, la flexibilité et la rigidité dynamique, en mettant l'accent sur les collecteurs symlectiques et les sous-manifolds lagrangés.